Title of article :
Morphology and Phylogeny of Scrippsiella trochoidea (Dinophyceae) a potentially harmful bloom forming speciesisolated from the sediments of Iran’s south coast
Author/Authors :
Attaran-Fariman ، G نويسنده Marine science Faculty, Chabahar Maritime University, Chabahar, Iran , , Bolch ، c. j. s نويسنده School of Aquaculture, University of Tasmania, Launceston, Australia ,
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 2012
Abstract :
سيست و سلولهاي پلانكتوني Scrippsiella trochoidea از گونه هاي متداول و غالب فلور داينو فلاژلاها درآبها و رسوبات نواحي ساحلي در همه مناطق دنيا مي باشد. اين گونه يكي از گونه هاي بسيار رايج تشكيل دهنده بلومهاي مضر فيتوپلانكتوني در مناطق ساحلي مي باشد. در اين بررسي براي اولين بار سيست گونه S. trochoidea از رسوبات جنوب شرق ايران جدا سازي گرديد. 5 ايزوله از گونه هاي كشت داده شده متعلق به گونه S. trochoidea بودند. به منظور تاييد شناسايي گونه ها آزمايشات اگزسيتمنت و اين سيستمنت انجام گرديد و ريخت شناسي سيست و الگوي صفحات سلولهاي شكوفا شده با استفاده از ميكروسكوپ نوري و الكتروني(SEM) مورد بررسي قرار گرفت. توالي نوكليوتيدهاي DNA ريبوزومي در دو ناحيه بسيار متنوع ژني ITS1,ITS2 و همينطور ناحيه 5.8S براي همه ايزوله ها بررسي گرديد. براي تعيين روابط فيلوژنتيك توالي نوكليوتيدي 5 ايزوله ايراني با توالي هاي همولوگ در بانك ژن مقايسه گرديد. هر دو آناليزهاي NJو Mp و بررسيهاي ريخت شناسي نشان دادند كه هر پنج ايزوله ايراني متعلق به گونه S. trochoidea و با گونه هاي توصيف شده قبلي S. trochoidea و همينطور با گونه Calciodinellum levantinum كلاستر مي شوند و رابطه خويشاوندي نزديكي با گونه Scrippsiella sp. با ميزان %1.2 -%1.4 تنوع ژني را نشان دادند. نتايج اين اين مطالعه نشان داد كه اگر مطالعات مولكولي DNA ريبوزومي با ريخت شناسي سيست و سلول پلانكتوني شكوفا شده گونه همراه باشد مي تواند به عنوان دستاورد با ارزشي در شناسايي و طبقه بندي داينوفلاژلاهاي calciodinelloideae باشد.
Abstract :
Phytoplankton cells and resting cysts of the species Scrippsiella trochoidea are regular and dominant components of the dinoflagellate flora of coastal marine waters and sediments around the world. This species is a common harmful bloom forming species in coastal waters. In this study, for the first time cyst of S. trochoidea were isolated from the sediments of southeast coast of Iran. Five strains from the germination of a single cyst belonged to S. trochoidea. In order to confirm identification of the species an excystment and encystment experiment, cyst and germinated cell morphology and plate pattern by light and electron microscopy (SEM) have been described. The nucleotide sequences of two highly diverse regions, the rDNA-ITS 1,2 and 5.8S-rDNA have been sequenced for all strains. Homologous sequences from GenBank with five Iranian strains were compared to find their phylogenetic relationship. Both NJ and MP phylogenetic and morphological analysis showed five strains of S. trochoidea from Iran were clustered with previously described S. trochoidea and Calciodinellum levantinum species, and its closest relationship was with Scrippsiella sp. strain with a 1.2-1.4% sequence divergence. Results indicate that molecular studies of rDNA if combined with morphological cyst and vegetative cells could be a valuable approach to identification and taxonomy of calciodinelloideae dinoflagellate.
Journal title :
Iranian Journal of Fisheries Sciences
Journal title :
Iranian Journal of Fisheries Sciences