Title of article :
Independence of color intensity variation in red flesh apples from the number of repeat units in promoter region of the MdMYB10 gene as an allele to MdMYB1 and MdMYBA
Author/Authors :
Mahmoudi، Ebrahim نويسنده Department of Agricultural Biotechnology, Tarbiat Modares University, P.O. Box 14115-154, Tehran, I.R. Iran , , Mohammad Soltani، Bahram نويسنده Department of Genetics, Faculty of Biological Science, Tarbiat Modares University, P.O. Box 14115-154, Tehran, I.R. Iran , , Yadollahi، Abbas نويسنده Department of Horticultural Sciences, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, P.O. Box 14115-336 , Tehran, I.R. Iran , , Hosseini، Ebrahim نويسنده Department of Genetics, Faculty of Biological Science, Tarbiat Modares University, P.O. Box 14115-154, Tehran, I.R. Iran ,
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 2012
Pages :
8
From page :
153
To page :
160
Abstract :
بيان ژن MdMYB10 منجر به تجمع آنتوسيانين در بسياري از بافتهاي سيب از جمله گوشت ميوه مي شود. دو ژن MdMYB1 و MdMYBA همولوگهاي ژن MdMYB10 مي باشند كه هر دو مسيول فنوتيپ رنگ قرمز در پوست سيب هستند. در تحقيق حاضر، بررسي يك مجموعه از توالي ژنوم سيب نشان داد كه هر سه ژن مذكور در كنار هم و در يك كانتيگ قرار گرفته اند. بررسي هاي بيشتر حاكي از آن است كه اين سه ژن همولوگ، اللهاي يك لوكوس هستند كه تنها درتعداد تكرار يك ناحيه تكراري در پروموتر اختلاف دارند. اين ناحيه ي تكراري در ژن MdMYB10 موجب بيان بالاي آن در اكثر بافتهاي گياه مي شود در حاليكه فقدان چنين ناحيه تكراري در پروموتر اللهاي MdMYB1 و MdMYBA موجب بيان محدود اين دو ژن در پوست ميوه مي گردد. علاوه بر اين، با در نظر گرفتن سابقه موضوع و نتايج اين تحقيق، ما يك الگوي بيان وابسته به ژنوم و وابسته به بافت براي اين سه الل پيشنهاد كرديم. هيچگونه تنوعي در توالي يا تعداد تكرارهاي ناحيه پروموتري مذكور در واريانت هاي جغرافيايي سيب هاي گوشت قرمز ايراني مشاهده نشد. اين يافته بيانگر عدم وابستگي شدت و تنوع رنگ گوشت سيب به تعداد تكرار در ناحيه پروموتري است. همچنين بيانگر اين است كه اين توالي تكراري يكبار در طول تكامل حاصل شده و تنوعي نيافته است.
Abstract :
MdMYB10 gene expression results in accumulation of anthocyanin in many tissues including flesh of apple fruit. The MdMYB1 and MdMYBA genes are close homologues to MdMYB10 gene and both are responsible for red color phenotype in apple fruit skin. In the current study, an apple genome sequence draft analysis indicated that these three genes are located in a unique contig. Further analysis suggested that these homologues are alleles of a single locus and they differ in a repeated sequence of the promoter region. This repeated sequence ensures high expression level of MdMYB10 in most of the plant tissues while MdMYB1 and MdMYBA alleles lack such a repeated sequence in their promoters and their expression is confined to the fruit skin. Also, we suggest a tissue- and genome-specific expression pattern for these three alleles considering our data and other recent publications. No variation was detected in the sequence or in the number of repeats of MdMYB10 promoter in Iranian red flesh apple geo-variants, pointing that the number of repeat is not related to flesh color intensity or variation, and the repeat elements have occurred once during the evolution.
Journal title :
Iranian Journal of Biotechnology (IJB)
Serial Year :
2012
Journal title :
Iranian Journal of Biotechnology (IJB)
Record number :
681344
Link To Document :
بازگشت