In silico fusion of epsilon and beta toxin genes of Clostridium perfringens types D and B

فن آوري فيوژن پروتيين يك استراتژي كارآمد با صرفه اقتصادي و پرسرعت براي بيان پروتيين است. توكسين هاي اپسيلون و بتا كلستريديوم پرفرينجنز از توكسين هاي قوي كلستريديايي به شمارمي آيند كه مي توانند بيماري هاي كشنده اي را در دام توليد كنند. مقاله حاضر فيوژن آزمايشگاهي(in silico) ژن هاي اپسيلون و بتا كلستريديوم پرفرينجنز تيپ هاي D و Bرا كه براي كلونينگ در E.coli استفاده شده اند مورد بررسي قرار مي دهد. ژن هاي etx و cpbاز ژن بانك بدست آمد و فيوژن ژن مورد نياز براي توليد فيوژن پروتيين كايمريك طراحي گرديد. ساختمان هاي دوم وسوم و ويژگي هاي فيوژن پروتيين با استفاده از نرم افزار هاي آنلاين بيوانفورماتيك تعيين گرديد. نتايج نشان دادند كه فيوژن ژن طراحي شده از ساختار مناسبي براي بيان فيوژن پروتيين مورد نظر برخوردار است.

Fusion protein technology represents the strategy to achieve rapid, efficient, and cost-effective protein expression. Epsilon and Beta toxins are the most potent Clostridial toxins and cause disease in animals. This study describes in silico fusion of Clostridium perfringens types D and B epsilon and beta toxin genes that was used for cloning in E. coli. The etx and cpb genes were retrieved from the GenBank and a fusion gene was designed to produce a chimeric fusion protein. Secondary and tertiary structures and specificities of fusion protein were determined by online software. Results showed that the designed fusion gene construction is suitable for chimeric fusion protein expression.