Title of article :
Genetic variability of calpastatin and calpain genes in Iranian Zel sheep using PCR-RFLP and PCR-SSCP methods
Author/Authors :
Dehnavi، Elena نويسنده Department of Animal Science, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, P.O. Box 4913815739, Gorgan, I.R. Iran , , Ahani Azari، Mojtaba نويسنده Department of Animal Science, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, P.O. Box 4913815739, Gorgan, I.R. Iran , , Hasani، Saeed نويسنده Department of Animal Science, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, P.O. Box 4913815739, Gorgan, I.R. Iran , , Nassiry، Mohammad Reza نويسنده , , Mohajer، Mokhtar نويسنده Golestan Agriculture Jahad, P.O. Box 49174, Gorgan, I.R. Iran Gonbad, I.R. Iran , , Khan Ahmadi، Ali Reza نويسنده Department of Animal Science, Faculty of Gonbad, P.O. Box 4971799151, Gonbad, I.R. Iran ,
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 2012
Pages :
4
From page :
136
To page :
139
Abstract :
هدف از اين تحقيق شناسايي چند شكلي ژن هاي كالپاستاتين، كالپاين در يك گله گوسفند زل با روشهاي PCR-RFLP و PCR-SSCP بود. در اين تحقيق نمونه هاي خون از 200 راس گوسفند نر و ماده ايستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند شيرنگ وافع در شهر فاضل آباد_استان گلستان_ خونگيري شد و استخراج DNA به روش بهينه يافته نمكي انجام شد. واكنش زنجيره اي پليمراز جهت تكثير يك قطعه 622 جفت بازي شامل اينترون و اگزون اولين دامنه تكراري ژن كالپاستاتين و يك قطعه 190 جفت بازي ژن كالپاين شامل قسمتي از اگزون 5 و6 و اينترون مابين آنها انجام گرفت. در تحقيق حاضر چندشكلي ناحيه تكثير شده ژن كالپاستاتين با هر دو روش فوق بررسي شد. در مورد روشRFLP، قطعه تكثير شده ي اين ژن ، به طور جداگانه توسط دو آنزيم رستريكتاز MspI و NcoI مورد هضم قرار گرفت و دو آلل M و N بهترتيب با فراواني هاي 855/0 و 145/0 شناسايي شدند. به كمك روش SSCP، آلل هاي A، B و C به ترتيب با فراواني هاي 835/0، 145/0 و 020/0 مشاهده گرديد. در مورد ژن كالپاين صرفا از روش PCR-SSCP استفاده شد. در نتيجه تك رشته اي كردن ناحيه مورد مطالعه ژن كالپاين با بافر SSCP، آلل هاي A و B بهترتيب با فراواني هاي 845/0 و 155/0 مشاهده گرديد. نتايج بدست آمده وجود تعادل هارديواينبرگ را فقط براي ژن كالپاستاتين با روشSSCP نشان داد (05/0 < P) و براي ساير جايگاه ها وجود تعادل هارديواينبرگ را تاييد نكرد (05/0 > P). متوسط هتروزيگوسيتي در هر دو جايگاه پايين بود كه حاكي از بالا بودن هموزيگوسيتي در گله مي باشد. باتوجه به وجود چندشكلي در اين جايگاه ها و نقش ژن هاي مذكور در كميت و كيفيت گوشت به نظر مي رسد مي توان از اطلاعات بدست آمده براي يافتن ژنوتيپ هاي موثر بر صفات اقتصادي در گوسفند زل استفاده كرد.
Abstract :
The genotypes for calpastatin (CAST) and calpain (CAPN) loci were determined by PCR-RFLP and PCR-SSCP methods. Blood samples were collected from 200 pure-bred Zel sheep from Shirang’s Zel sheep Breeding Station located in south-west of Golestan, Iran. Extraction of genomic DNA was performed based on the modified salting out method. Based on results, two investigated loci were polymorphic and had different gene variants. Heterozygosis was low for both loci. Chi-square test confirmed Hardy-Weinberg equilibrium only in CAST locus using SSCP method. Detected polymorphisms and associations of genetic variation with meat production and tenderness may help to find the effective genotypes of Zel sheep for the economic traits.
Journal title :
Iranian Journal of Biotechnology (IJB)
Serial Year :
2012
Journal title :
Iranian Journal of Biotechnology (IJB)
Record number :
681899
Link To Document :
بازگشت