Genetic relationships among collections of the Persian sturgeon, Acipenser percicus, in the south Caspian Sea detected by mitochondrial DNA–Restriction fragment length polymorphisms

در مطالعه حاضر، به منظور تعيين ساختار ژنتيك جمعيت تاس ماهي ايراني (Acipenser persicus) درياي خزر روش هضم آنزيمي (PCR-RFLP) ژن ND5 در DNA ميتوكندريايي مورد استفاده قرار گرفت. در مجموع تعداد 154 نمونه باله تاس ماهي ايراني از 6 منطقه مختلف سواحل جنوبي درياي خزر جمع آوري گرديد. كميت DNAنمونه ها به روش اسپكتروفتومتري و كيفيت آن از طريق الكتروفورز ژل آگارز و رنگ آميزي با اتيديوم برومايد تعيين شد. هضم آنزيمي ژن ND5 با استفاده از 5 آنزيم برشگر پلي مورفيك شامل Mbo ?، Cfr13?، HaeIII، Hinf ? و Rsa ? انجام گرفت و الگوي هضم آنزيمي با استفاده از الكتروفورز ژل پلي اكريل آميد 6% و رنگ آميزي نيترات نقره مشاهده شد. در مجموع بين 154 نمونه مورد مطالعه 17 هاپلوتيپ متفاوت بدست آمد. تنوع هاپلوتايپي و نوكليوتيدي به ترتيب 038/0 ± 739/0 و 0043/0 ± 0105/0 بدست آمد. آناليز واريانس مولكولي (AMOVA) نشان داد در رودخانه سفيدرود از سواحل جنوبي درياي خزر اختلاف معني داري مشاهده گرديد (001/0 > P) و در نهايت وجود يك جمعيت مشخص گرديد و نشان داده شد كه توزيع هاپلوتيپ ها در بين مناطق مختلف نمونه برداري اختلاف معني داري دارد (?2= 37.12 , P < 0.0001). با توجه به نتايج روش به كار گرفته شده مشخص گرديد كه در درياي خزر جمعيت هاي مستقلي از تاسماهي ايراني بوده بطوريكه نمونه هاي رودخانه سفيدرود جمعيت مستقلي از اين گونه را تشكيل داده و از نظر ژنتيكي منبع بسيار ارزشمندي محسوب مي شوند و بايستي به صورت جداگانه مديريت شوند

In the present study, mitochondrial DNA polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay was used to assess the population structure and genetic relationships among six Persian sturgeon, Acipenser persicus populations from south Caspian Sea along the Iranian coast. The complete nucleotide dehydrogenase subunit 5 (NADH 5) region of mtDNA amplified by PCR was digested with five restriction enzymes. In total, 154 individuals from six populations including: Guilan (Zone1-2), Mazandaran (Zone 3 and 5), Golestan (Zone 4) and Sefidroud River, from south Caspian Sea along the Iranian coast were analyzed using five restriction endonucleases (Rsa ?, Hinf ?, HaeIII, Mbo ? and Cfr13?), yielding 17 haplotypes. Samples from Sefidroud River were clearly identified by cluster and molecular variance model (AMOVA) analyses. This collection showed dominant haplotypes that were little in populations from the other geographic areas. The mean haplotype diversity (h) and nucleotide diversity (?) were 0.739±0.038 and 0.0105±0.0043, respectively. Based on heterogeneity test haplotype frequencies of Persian sturgeon populations and Monte-Carlo with 1000 replicates in PCR-RFLP method significant differences were seen (?2 =37.12, P < 0.0001) and these results showed that haplotype distribution in different location were significant and populations of Sefidroud were statistically significant (P < 0.0001). This result suggests that the unique genetic structure of Sefidroud River represents a highly valuable genetic resource and should now be treated as demographically independent and managed separately.