Molecular typing of avian Escherichia coli isolates by enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences-polymerase chain reaction (ERIC-PCR)

زمينه مطالعه: كلي باسيلوز در سرتاسر دنيا به عنوان يكي از پر اهميت ترين بيماري‌هاي طيور از نظر اقتصادي محسوب مي‌گردد. هدف: اين مـطـالعه به منظور ارزيابي سطح ارتباط كلونال و تايپينگ ملكولي 95 جدايه اشريشياكلي طيور توسط آزمون ERIC-PCR انجام گرفت. روش‌كار:‌ ‌تعداد 63 جدايه اشريشياكلي از دو تظاهر باليني متداول كلي باسيلوز (عفونت كيسه زرده و كلي سپتيسمي) و 32 جدايه از مدفوع ماكيان گوشتي ظاهرا سالم جداسازي شد. هر يك از جدايه‌هاي مذكور 2 بار تحت آزمون PCR قرار گرفت. نتايج:‌ ‌وزن ملكولي باندهاي مشاهده شده برروي ژل الكتروفورز از 232 تا 2690 جفت باز متغيير بود. بر اساس تعداد و وزن ملكولي باندهاي تشكيل شده 65 الگوي انگشت نگاري متفاوت توسط 95 جدايه مذكور نشان داده شد. تعداد 20، 22 و 23 الگوي انگشت نگاري متفاوت به ترتيب در بين جدايه‌هاي حاصل از عفونت كيسه زرده، كلي سپتيسمي و مدفوع مورد شناسايي قرار گرفت. مابين الگوهاي انگشت نگاري متفاوت، تعداد باندهاي تشكيل شده از 2 تا 11 عدد متغيير بود. هيچ الگوي انگشت نگاري مشابهي مابين جدايه‌هاي متعلق به 3 منبع ذكر شده مشاهده نگرديد. جدايه‌هايي نيز كه در هر يك از گروه‌ها الگوهاي انگشت نگاري مشابهي نشان مي‌دادند، از يك مزرعه واحد جداسازي شده بودند. با اين حال، تعداد اندكي از جدايه‌هاي جداسازي شده از مزارع متفاوت نيز الگوهاي انگشت نگاري يكسان ايجاد نمودند. نتيجه گيري نهايي: در پايان، اين مطالعه بيانگر حضور سطح بالايي از پلي مورفيسم مابين جدايه‌هاي اشريشياكلي به دست آمده از منابع مختلف بوده و بر اين اساس مي توان بيان نمود كه تظاهرات باليني متفاوت كلي باسيلوز توسط ژنوتايپ‌هاي اختصاصي ايجاد نمي گردند.

BACKGROUND: Colibacillosis is one of the most economically important diseases of poultry worldwide. OBJECTIVES: This study was conducted to examine the clonal relatedness and typing of 95 avian Escherichia coli isolates by ERIC-PCR. METHODS: Sixty-three E. coli isolates from two common manifestations of colibacillosis (yolk sac infection and colisepticemia) and 32 isolates from feces of apparently healthy broilers were provided. The PCR amplification reactions were performed in duplicate for all isolates. RESULTS: The molecular weight of the observed bands on gel electrophoresis ranged from 232 bp to 2690 bp. Sixty-five fingerprinting patterns were observed among 95 isolates on the basis of molecular weights and the number of bands. The numbers of 20, 22, and 23 fingerprinting patterns were found among isolates from yolk sac infection, colisepticemia, and feces, respectively. Among different fingerprinting patterns, the number of produced bands differed from 2 to 11. No identical pattern was observed among isolates of three sources. Isolates showing similar patterns in each source group belonged to a single farm. However, a few isolates that had been isolated from different farms also showed similar fingerprinting patterns. CONCLUSIONS: In conclusion, this study showed a high degree of polymorphism among E. coli isolates originated from different poultry sources when the respective bacterial genomes were analyzed by the ERIC-PCR and that no specific genotypes were responsible for different manifest-ations of colibacillosis.