عنوان :
بهگزيني گله هاي پيش مولدين ماهي قزل آلاي رنگين كمان و معرفي خانواده هاي برتر با استفاده از شاخص هاي ژنتيكي رشد
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
نظري، سجاد
شناسه هاي افزوده :
پوركاظمي، محمد ، همكار طرح , قادري زفره‌اي، مصطفي ، همكار طرح , نجار لشگري، سلطنت ، همكار طرح , آقايي، خديجه ، همكار طرح , محمودي، رقيه ، همكار طرح
تنالگان :
سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
چكيده فارسي :
با توجه به پيشرفتهاي اخير فن آوريهاي ژنومي بخصوص شناسايي نشانگرهاي مولكولي در قزل آلاي رنگين كمان (Oncorhynchus mykiss) ، مي توان به كاربرد بيشتر اين نشانگرها در انتخاب جمعيتهاي مختلف اين گونه در برنامه هاي اصلاح نژادي در كشور جهت افزايش راندمان توليد بهره گرفت. امروزه از نشانگرهاي مولكولي و به ويژه نشانگرهاي مبتني بر DNA به طور گسترده اي در بسياري زمينه ها از قبيل بررسي تنوع ژنتيكي يا روابط ژنتيكي، نقشه يابي و رديابي ژن ها،شناسايي ژنهاي موثر بر صفات كمي و انتخاب به كمك نشانگرها استفاده مي شود. پروژه حاضر بخشي از طرح "ارزيابي ژنتيكي ماهي قزل آلاي رنگين كمان پرورشي جهت توليد ماهيان عاري از بيماريهاي خاص (SPF) " با هدف انجام روش هاي ژنتيك مولكولي صفات كمي ماهيان قزل آلاي رنگين كمان پرورشي اجرا گرديد. پس از انتقال 7 گروه از ماهيان قزل آلاي رنگين كمان مراكز منتخب مورد تاييد سازمان دامپزشكي كشور و سازمان شيلات ايران در استان هاي مازندران، آذربايجان غربي و كهگيلويه و بوير احمد به سالن پيش قرنطينه در مركز تحقيقات ماهيان سردآبي كشور، ثبت داده هاي بيومتري در فصول تابستان و زمستان سال 1396، از بافت باله مولدين نمونه برداري صورت پذيرفت. استخراج ژنوم از تمامي نمونه ها نيز بر اساس روش فنل- كلروفرم انجام و در ادامه كيفيت و كميت DNA بااستفاده از روش اسپكتروفتومتري و ژل آگارز ارزيابي گرديد. جهت تكثير جايگاه ژن پذيرنده هورمون رشد GHR، از نواحي مختلف اينترون و اگزون ژن تعداد 12 جفت آغازگر و روش PCR-SSCP استفاده شد. بررسي محصول PCR ژن هورمون رشد قزل آلاي رنگين كمان، بر روي ژل آگارز 8/0%، نشان دهنده تكثير قطعات واحدي به طول حدود ، 246 ، 185، 220 ، 163 ، جفت بازي (bp) براي آغازگرهاي RH1، RH 2، RH 3 و RH 5 ژن هورمون رشد بود. نتايج بررسي ارتباط بين صفات كمي وزن و طول مولدين قزل آلاي رنگين كمان در مزارع پرورشي مختلف از استانهاي مازندران، كهگيلويه و بويراحمد، آذربايجان غربي با دو جفت چندشكلي تك نوكلئوتيدي (SNP) شناسايي شده در ژن هورمون رشد GHR ارتباط معني داري را نشان نداد (P>0.05) . نتايج حاصل از اين تحقيق و چندشكلي هاي تك نوكلئوتيدي مشاهده شده در ژن پذيرنده هورمون رشد GHR را مي توان در مطالعات آينده و فاز دوم طرح كلان SPF در دوره رشد كامل ماهيان قزل آلاي رنگين كمان استفاده نمود.
چكيده انگليسي :
Aquaculture coldwater fishes have expanded rapidly to address the increasing demand for aquatic protein needs and an uncertain future for genetic and breeding programs. Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) are the most widely farmed cold freshwater species and the first most valuable aquaculture product in Iran. To date little is known about their breeding or the genes that affect important economic traits in culture using molecular approaches. Recently, the application of genomic technologies specially identification of molecular markers towards the genetic improvement of aquaculture species is expected to facilitate selective breeding and development of strains of rainbow trout via breeding programs will be the solution to this problem in global market. Molecular genetic markers chiefly markers based on DNA are widely used for genetic mapping, genetic variation, gene effecting quantitative traits and marker assisted selection. In this project, a suite of genome tools for rainbow trout will develop to identify and characterize genes affecting aquaculture production traits. Seven broodstock groups of rainbow trout (n=1750) for generating full and half sibling will collect in different farms in Iran. Juveniles will raise at the ponds. The sequences of candidate genes including growth hormone gene was extracted in genebank and then based on the complete sequences primers will design using software Oligo and Genrunner. Genome extracted based on standard method and these individuals randomly selected for direct sequencing of candidate genes. SNP genotyping performed by direct sequencing of the PCR products. For association analysis, all sequences analyze for SNP discovery. Association analyses between genotypes of candidate genes and quantitative traits performed using software Codon Code Aligner and BioEdit and SPSS. This information is important to gain a better understanding of the genetics of production traits and for transferring genetic information and improved selective breeding program to farms in Iran.
كليدواژه :
قزل آلاي رنگين كمان , نشانگرهاي مولكولي , صفات كمي , ژن هورمون رشد
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
جدول، رنگي، مصور، نمودار
فروست :
موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 57325
