عنوان :
شناسائي و ارزيابي تنوع ژنتيكي ميگوهاي سفيد غربي براي نسلهاي مختلف
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
خليل پذير، محمد
شناسه هاي افزوده :
سيمروني، محمد مهدي ، همكارطرح , حسيني، جواد ، همكارطرح
تنالگان :
سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
چكيده فارسي :
هدف از اين مطالعه تعيين شاخص‌هاي ژنتيكي، تفاوت‌هاي ژنتيكي و و روابط خويشاوندي شب نسلهاي مختلف ميگوي سفيد غربي عاري از بيماري خاص با استفاده از روش‌هاي مولكولي بود. نمونه‌هاي بافتي ميگو بصورت تصادفي از مناطق مختلف جمع آوري شد. بااستفاده از روش مولكولي ريزماهواه شاخص‌هاي ژنتيكي توسط 12 پرايمر اختصاصي ميگوي سفيد غربي مورد بررسي قرار گرفت. در اين مطالعه دو جمعيت مولوكائي و هاي‌هلث به عنوان مولدين نسل صفر ميگوي عاري از بيماري خاص شناسايي شدند. از آميزش درون گروهي و بين گروهي صورت گرفته ميان مولدين نر و ماده دو جمعيت فوق در نهايت سه ذخيره مختلف H♂×M♀، M♂×H♀ و H♀×H♂ در نسل اول توليد شدند كه در ادامه ميگوهاي ذخيره H♂×M♀ جهت توليد ميگوهاي نسل دوم بكار برده شدند. همچنين تفاوت‌هاي ژنتيكي و رابطه خويشاوندي نسلهاي مختلف ميگو از طريق مناطق 16S rRNA و d-loop مورد بررسي قرار گرفت. نتايح نشان داد كه يك اختلاف معني دار در ميزان فاصله ژنتيكي ميان جمعيت‌هاي مختلف نسل صفر وجود دارد (615/0). ازسوي ديگر تمايز ژنتيكي ذخيره‌هاي مولوكائي×هاي‌هلث و هاي‌هلث‌مولوكائي به ميزان 078/0 بطور معني دار متفاوت بود (P <0.001). تجزيه و تحليل منطقه d-loop ژنوم ميتوكندريال نسلهاي مختلف ميگو حاكي از آن بود كه از 997 جايگاه شناسايي شده در هر يك از نسلهاي مختلف ميگو تعداد هاپلوتيپ‌ها و جايگاه‌هاي مونومورف محاسبه شده به ترتيب در دامنه 6-3 و 799-766 قرار داشت. با وجود اينكه ميزان تنوع هاپلوتيپي و تنوع نوكلئوتيدي براي كل نسلهاي مختلف ميگوي عاري از بيماري خاص به ترتيب 877/0 و 12/0 درصد بود. اين در حالي بود كه نتايج حاصل از منطقه 16S rRNA حاكي از آن بود كه از 486 جايگاه شناسايي شده 484 جايگاه بصورت محافظت شده مشاهده شد. جايگاه مونومورف در دامنه 486-482 قرار داشت و شامل 2 جايگاه پلي‌مورف و 2 جايگاه انتقالي بود. اين در حالي بود تنها 2 هاپلوتيپ شناسايي شد كه ميزان تنوع هاپلوتيپي و تنوع نوكلئوتيدي محاسبه شده به ترتيب 159/0±356/0 و 00147/0 محاسبه شد. ليكن نتايج نشان داد كه ميزان هموزيگوسيتي از نسلي به نسل ديگر در حال افزايش است به گونه‌اي فاصله ژنتيكي اندكي ميان نسلهاي مختلف ميگوي عاري از بيماري خاص مشاهده شد. لذا با توجه به نتايج بدست آمده اينگونه مي‌توان عنوان نمود كه عدم ورود مولد جديد از خارج از كشور و آميزش‌هاي صورت گرفته ميان مولدين نر و ماده خويشاوند به دليل كوچك شدن جمعيت مؤثر و رانش ژنتيكي ايجاد شده تعداد هاپلوتيپ‌ها از نسل صفر به نسل دوم به تدريج كاهش يافته بود. از اين رو به دليل رابطه خويشاوندي بالاي ميان نسلهاي مختلف ميگو در بررسي مناطق d-loop و 16S rRNA ژنوم ميتوكندري اختلاف ژنتيكي كمي ميان آنها مشاهده شد.
چكيده انگليسي :
The aim of this study was to determin the genetic parameters, genetic differentiation and relative relationship between different generations of specific pathogenic free of L.vannamei via molecular methods. Tissue samples of shrimp were randomly get caught from the different area. Genetic parameters were evaluated by 12 special primers of L.vannamei via microsatellite assay. In this study, two population of Molokaei and High health were identified as shrimp broodstocks of specific disease free (SPF) zero generation. Breeding among shrimp (males and females) were through inbreeding and crossbreeding. Three various stocks were produced: H♂ × M♀, M♂ × H♀ and H♀ × H♂. Genetic differences and relative relative relationship between different generations of specific pathogenic free shrimp were to evaluate by evaluation of 16S rRNA and d-loop region mitochondrial of different generations, respectively. The results showed that significant differences were observed among genetic distance of different populations of L.vannamei farmed (0.615). There were o.o78 Fst value of M.H and H.M stokes that it was a significant difference (P <0.001). The analysis of d-loop region of mitochondrial genomes of different generations shrimp was observed 997 positions with 3-6 and 766-799 of haplotype and monomorphic, respectively. Despite haplotype diversity and nucleotide diversity of all generations SPF shrimp were 0.877 and 0.12, respectively. While, Base on result of 16S rRNA indicated that of 486 sites have been identified 484 sites were conserved. Also, monomorphic sites ranged between 482-486 sites and was consists 2 polymorphic sites and 2 transitional sites. The number haplotypes, haplotypes diversity, nucleotide diversity revealed in this region were 2, 0.356±0.159 and 0.00147, respectively. Regarding the results of in this study can be concluded that lack of arriving new broodstocks from outside the country and was mating between adult males and females relative (full-sib) addition to small effective population size there was both genetic drift and number of haplotypes was gradually reduced from zero generation to second generation. Hence, due to the high close relationship between different generations shrimp evaluation of d-loop and 16S rRNA regions of the mitochondrial genome were little genetic difference between them.
كليدواژه :
نشانگر d-loop , ميگوي سفيد غربي , شاخص‌هاي ژنتيكي , ريزماهواره , ژنوم ميتوكندري , نشانگر 16S rRNA
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
مصور (رنگي)، جدول، نمودار (رنگي)
فروست :
موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 51083
