عنوان :
ايجاد بانك ژن ماهيان خليج فارس و درياي عمان
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
غرقي، احمد
شناسه هاي افزوده :
پور‌كاظمي، محمد ، همكارطرح , صالحي، غلامرضا ، همكارطرح , لالويي، فرامرز ، همكارطرح , حسيني، محمد‌رضا ، همكارطرح , آيين‌جمشيد، خسرو ، همكارطرح , آذيني، محمود‌رضا ، همكارطرح , احتشامي، فريبرز ، همكارطرح , مال‌الهي، احمد ، همكارطرح , جرفي، الهام ، همكارطرح , صفري، رضا ، همكارطرح , حاج‌رضايي، سعيد ، همكارطرح , مقصود‌لو، الهام ، همكارطرح , سنجري، محمد ، همكارطرح , ولي‌نسب، تورج ، همكارطرح , مرادي، يزدان ، همكارطرح , رضواني، سهراب ، همكارطرح , حسين‌زاده صحافي، همايون ، همكارطرح , ناظمي، مليكا ، همكارطرح , عبد‌الحي، حسين ، همكارطرح , امين‌زاده، سعيد ، همكارطرح , پيشه‌ور زاد، فاطمه ، همكارطرح , صفوي، ابراهيم ، همكارطرح , مطلبي، عباس‌علي ، همكارطرح , تمدني، سعيد ، همكارطرح , دشتيان نسب، عقيل ، همكارطرح , عابديان، آرمين ، همكارطرح
تنالگان :
ﺳﺎزﻣﺎن ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت، آﻣﻮزش و ﺗﺮوﯾﺞﮐﺸﺎورزي - ﻣﻮﺳﺴﻪ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت ﻋﻠﻮم ﺷﯿﻼﺗﯽ ﮐﺸﻮر
چكيده فارسي :
مطالعات ژنتيك و ايجاد بانك ژن مي تواند رهنمودهايي براي بهبود تنوع و شناسايي ساختار جمعيت ، صيد قاچاق ، تشخيص ميزان هم خوني و طبقه بندي ژنتيكي جانوران ارايه نمايد . در اين تحقيق نمونه برداري از مناطق مهم زيستگاه هاي گونه هاي مورد مطالعه مانندپوگزنده با نام علمي Dasyatisbennetti، گربه ماهي بزرگ با نام علمي Netumathalassina ، گربهماهيپوزهگرد با نام علمي Netumabilineata ، كوسهماهيشبهدنداننما با نام علمي Carcharhinusleucas ، زمردماهينواراريب با نام علمي Choerodonrobustus ، گيشپوزهدراز با نام علمي Carangoideschrysophrys ، كفشكپهن چپ رخ با نام علمي Pseudorhombusarsius ، هوور معمولي با نام علمي Thunnus tonggol ، زرده با نام علمي Euthynnusaffinisو در نهايت يال اسبي با نام علمي Trichiuruslepturus انجام گرفت. استخراج DNATotal با استفاده از فنل – كلروفورم انجام گرديد. استفاده از روش فنل كلروفرم از متداول ترين روشها در اكثر آزمايشات مولكولي در جهت دستيابي به DNA با وزن مولكولي و كيفيت بالا در تهيه بانك ژن ميباشد.پس از توالي يابي با استفاده از نرم افزار BioEdit و ابزار قدرتمند Blast و رويه Blasten در پايگاه NCBI ميزان همولوژي توالي هاي بدست آمده سنجيده شد و و رسم درخت فايلوژني و ميزان فاصله ژنتيكي گونه هاي مورد نظرانجام گرديد.بر اساس نتايج به دست آمده، نسبت جذب طول موج 260 به طول موج 280 نانومتر در نمونه ها بين 8/1– 1/2 قرار داشت كه نشانگر كيفيت خوب DNA نمونه ها بود. بهينه سازي واكنش PCR جهت تكثير ژن 16SrRNA با استفاده از گراديانت دمايي60- 48 درجه سانتيگراد نشان داد كه مناسب-ترين دما براي اتصال آغازگر، دما هاي58-54درجه سانتيگراد براي نمونه هاي مختلف محاسبه گرديد.اين طرح با اهدافي از جمله شناسايي ساختار ژنتيكي گونه ها، و رسم درخت فايلوژني آنها با استفاده از ژن 16s ، تهيه شناسنامه و ثبت كامپيوتري مشخصات سلولهاي ذخيره شده و ساماندهي ساختار و تمركز مديريت بر منابع ژنتيكي 10گونه مهم و در معرض تهديد از ماهيان منطقه خليج فارس از طريق ايجاد يك شبكه منسجم ذخاير ژنتيكي آبزيان اين منطقه سعي در شناسايي ذخاير ژنتيكي و ايجاد بانك ژن آبزيان با اهداف ذكر شده دارد.همچنين شناسايي گونه اي از كفشك ماهيان به نام Pseudorhombus pentophthalmus ميباشد كه به صورت يك هاپلوتايپ جديد با اختلاف ژنتيكي 7 درصدي از ديگر نمونه هاي ثبت شده در بانك جهاني ژن متمايز شده است از دستاوردهاي مهم اين تحقيق ميباشد.
چكيده انگليسي :
genetic studies and gene banks preparation can identify guidelines for improving diversity and population structure and estimation, poaching and also the amount of cross breeding and provide genetic classification. In this study, sampling was performed from the important studied species habitats areas for the species such as: Dasyatis bennetti ، Netuma thalassina, Netuma bilineata Carcharhinus leucas ،Choerodon robustus ،
Pseudorhombus pentophthalmus ،Pseudorhombus arsius Thunnus tonggol ،Euthynnus affinis and Trichiurus lepturus. Total DNA extraction was performed using phenol - chloroform method which is the most common method for DNA extraction in order to achieve high quality of DNA was performed in the preparation of gene bank in this study. After relevant studies on this gene primers were designed and in use. After editing the sequences, nucleotide
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) was performed using NCBI blast main page.The sequences obtained from each sample were aligned and corrected from any ambiguities and assembled using Bio edit program .Trees were generated using maximum parsimony (MP), a character-based algorithm and neighbor
joining (NJ) a distance-based algorithm for phenetic analysis. The distance matrix option of MEGA4 was used to
calculate genetic distance according to the Kimura 2-parameter model of sequence evolution. Based on the results obtained, the optical density of 260 to 280 nm in the samples was recorded between 1/8 - 2, indicating good quality DNA samples.
Optimized PCR reaction to 16SrRNA gene amplification using the gradient between 48 - 60° C showed that the most suitable criteria for binding primers, 54 to 58 Celsius degrees respectively.The project objectives including the identification of the genetic structure of the species, and draw the phylogenetic trees using two genes 16SrRNA, making identification and registration of specified computer storage and regulate the structure and
management of mentioned species by focus on genetic resources 10 species of majour commercial and noncommercial fishes in the Persia Gulf and Oman Sea through the creation of an integrated network of aquatic genetic resources in the region to try to identify genetic resources and aquatic gene bank.This type of analysis could be considered as an important tool to be used in broodstock selection in breeding programs. Also identify
the species of fish named as Pseudorhombus pentophthalmus with a new haplotype and genetic differences 7% in compare to the samples recorded in the World gene Bank can considered as a major achievements of this research.
كليدواژه :
بانك ژن ماهي , خليج فارس و درياي عمان , mtDNA , ذخاير ژنتيكي , 16s rRNA
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
مصور (بخشي رنگي)، جدول، نمودار
فروست :
موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 50849
يادداشت :
ص. ع. به انگليسي: Ahmad Ghoroghi. Fish gene bank of the Persian Gulf and Oman Sea
كتابنامه :
كتابنامه: ص. 55- 57
موضوع :
ماهي ها-- ژنتيك , ماهي ها-- ژنتيك مولكولي , ماهي ها-- اصلاح نژاد
