عنوان :
بررسي تنوع ژنتيكي و تشكيل كتابخانه ژني ذخاير ماهي كفال خاكستري (Mugil cephalus) از آبهاي مديترانه، اقيانوس آرام و درياي عمان به روشهاي مولكولي
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
رضواني گيل كلايي، سهراب
شناسه هاي افزوده :
غرقي، احمد ، همكارطرح , صفري، رقيه ، همكارطرح , قديرنژاد، حسن ، همكارطرح , حاميطبري، احمد ، همكارطرح , شافعي، عبدالقيوم ، همكارطرح , امينيراد، تيمور ، همكارطرح , عرفانيمقدم، وحيد ، همكارطرح , درباني، رحيم ، همكارطرح , ميرهاشميرستمي، امين ، همكارطرح , لالويي، فرامرز ، همكارطرح , فهيم، آذين ، همكارطرح
تنالگان :
وزارت ﺟﻬﺎد ﮐﺸﺎورزي - ﺳﺎزﻣﺎن ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت، آﻣﻮزش و ﺗﺮوﯾﺞﮐﺸﺎورزي - ﻣﻮﺳﺴﻪ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت ﻋﻠﻮم ﺷﯿﻼﺗﯽ ﮐﺸﻮر
چكيده فارسي :
در اين بررسي دو هدف از سه هدف پروژه تحقق پيدا كرده است كه در هدف اول آنبه منظورتعيين ساختار ژنتيك جمعيت ماهي كفال پوزه باريك در مناطق مخنلف حوضه جنوبي درياي خزر روش توالي يابي ژن 16S rRNA ميتوكندريايي به كار گرفته شد. تعداد 45 نمونه باله ماهي كفال پوزه باريك از نواحي غربي (انزلي) ، مياني (ساري) و شرقي (تالاب گميشان) حوضه جنوبي درياي خزر جمع آوري گرديد. توالي بدست آمده تنها از ژن مورد نظر bp552 قابل خواندن بود، در مجموع بين 6 هاپلوتايپ متفاوت و29 جايگاه متغير بدست آمد. تنوع هاپلوتايپي ونوكلئوتيدي در نمونه هاي كل مناطق به ترتيب برابر 0/29و 0/004 .بود.نتايج آناليز Fst بر اساس روش دوپامتري نشان داد كه تنوع در بين نمونه ها معني دار نبوده(05.0>P) و تنوع در درون نمونه ها مي باشد. برآورد جريان ژني ميزان بالائي از جريان ژني را بين نمونه هاي مناطق مختلف نشان داد وبين مناطق مختلف جدائي توليد مثلي وجود نداشت. نتايج اين بررسي پيشنهاد مي دهد كه تفاوت ژنتيكبين مناطق مختلف معني دار نبوده ومي توان عنوان نمود كه جمعيت يكساني از ماهي كفال پوزه باريك در مناطق مورد بررسي وجود دارد. .براي دسيابي به هدف دوم پروژه جهت تعيين تفاوتهاي ژنتيكي و روابط خويشاوندي ميان6گونه از خانواده كفالماهيان (Mugil cephalus، Liza subviridis، Valamugil buchanani، Lizasaliens،Liza aurata، Mugil capito،)از روش مولكوليPCR-sequencingاستفاده شد. DNA اين نمونه ها (كه از آبهاي درياي خزر و خليج فارس جمع آوري شدند) به روش فنل- كلروفرم استخراج گرديد. قعطعات ژنوم (16s rRNAميتوكندريايي) طي فرآيندPCR تكثير و سپس به روش اتوماتيك توالي يابي شدند. آناليز توالي ها نشان داد كه بيشترين تفاوت ژنتيكي بينM. cephalusو 5 گونه ديگر مورد مطالعه مشاهده شد.درخت بدست آمده بروش Neighbor-joiningنشان داد كه دو گونه L. saliensوL. aurata در يك شاخه و گونهL. subviridis در شاخه اي جدا قرار گرفتند درصورتيكه درخت رسم شده بروشMaximumparsimony نشان داد كه گونه هايL. SubviridisوL.aurataدر يك شاخه قرار مي گيرند و گونه L. saliensدر شاخه اي جدا قرار گرفت.باتوجه به اين نتايج، اين سوال مطرح مي شود كه چرا گونه هاي مختلف اين جنس در يك شاخه قرار نمي گيرند؟
چكيده انگليسي :
Two of the three objectives of project was carried out success that one of them is following: The genetic diversity of Liza salien(Risso,1810) in the south part of Caspian sea using the Mitochondrial DNA sequencing (mtDNA) was carried out as first objective of project that based on the mitochondrial DNA sequencing (mtDNA) of 16S rRNA was used in order to clarify genetic structure and genetic diversity of lizasaliens in three western (Anzali) , middle(sari) , and eastern(Gomishan lagoon) of south part of Caspian sea. As a result we obtained 552base pairs of 16SrRNA sequence. A total of 6 different haplotypes and 29 variable sites were identified .The average nucleotide diversity(π) and haplotype diversity(h) in samples of all regions were 0.29 , and 0.004 respectively . The results obtained from genetic distance showed low rate in that of 3 regions. Estimates of gene flow indicated there is no reproductive isolation between three regions and also there was not significant genetic differentiation between differentregions (p>0.05). the findings from the present study suggest that there is equal population of Liza saliens in the studied regions .: Genetic differences and phylogenic relationships among six Mugilidae species (Mugilcephalus, M. capito, Liza subviridis, L. saliens, L. aurata, Valamugilbuchanani) were determined using PCR-sequencing as second objective of project. M. cephalus, L. subviridis, and V. buchanani from the Persian Gulf and Oman Sea, and L. aurata and L. saliens from the Caspian Sea were collected. Samples of an imported, Egyptian species M. capito (this species was mixed with the main imported species as M. cephalusfingerling) were obtained from the Gomishan Research Center in Gorgan. Total DNA from the samples were extracted according to phenol-chloroform method Mithochondrial DNA ,16s RNA was amplified using thermo cyclermachine with universal primers and thensequenced by sending to Takapoozist Company and thereafter to France. Analysis of the sequences showed great differences between Mugil species and the other studied species. The phylogenetic tree obtained through Neighbor-Joining method revealed that L. saliensandL. aurata were in the same branch while L. subviridis was in a separate branch. In contrast, Maximum Parsimony tree located L. subviridis and L. aurata in a single branch and assigned L. saliens to a distinct branch. This result brings in the question of monophyletic origin of the genus Liza.Also.
كليدواژه :
موژيليده،فيلوژني , ايران , جمعيت , درياي خزر , خليج فارس و درياي عمان , PCR
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
بخشي رنگي، جدول، مصور، نمودار
فروست :
انتشارات موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 42353
كتابنامه :
كتابنامه: ص. 93- 101
موضوع :
كفال خاكستري- اصلاح نژاد , كفال خاكستري- درياي عمان , كفال خاكستري- اقيانوس آرام , كفال ماهي خط دار , ماهي پرورشي