عنوان :
بررسي ژنتيك جمعيت دو گونه ميگوي تجاري درياي عمان و خليج فارس و تعيين توالي نوكلئوتيدهاي بخشي از ژنوم ميتوكندريال به عنوان خط شناسه شش تا هشت گونه هاي ميگوي دريايي ايران با روش مولكولي (PCR-Sequencing)
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
رضواني گيل كلايي، سهراب
شناسه هاي افزوده :
نياميمندي، نصير ، همكار طرح , تمدني جهرمي ، سعيد ، همكار طرح
تنالگان :
سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور – مركز تحقيقات ذخاير آبزيان آبهاي داخلي
چكيده فارسي :
لغت ميگو (shrimp) به طور اختصاصي به سخت پوستاني گفته ميشود كه داراي شاخك بلند و پاهاي باريك ميباشند و ماهيچههاي شكمي آنها به طور جانبي فشرده ميباشد. اين ساختار منجر به افزايش سازش آنها براي شنا كردن به سمت جلو و پاسخ حركت رو به عقــــب به هنگـــام فرار شده است. مطالعات بسياري براي شناسايي و ردهبندي ميگوهاي ايران صورت گرفته كه منجر به شناسايي انواع زيادي از اين جانداران شده است. روش اصلي در اين بررسيها استفاده از دادههاي مورفولوژيكي بوده است. در اين مطالعه علاوه بر بررسي صفات ريختشناسي، دادههاي بدست آمده از تعيينتوالي ژن COI ميتوكندريايي و ژن 16SrRNA نيز مورد استفاده قرار گرفته است تا ژنتيك جمعيت دو گونه ميگوي تجاري درياي عمان و خليج فارس و خط شناسه شش گونه از ميگوهاي دريايي ايران مشخص شود. به همين منظور گونههاي انتخابي كه شامل شش گونه ميگو با نامهاي ميگوي سفيد هندي Fenoro penaeus indicus ، ميگوي موزي Fenoro penaeus merguensis ، ميگوي ببري سبز penaeus semisulcatus ، ميگوي سفيد Metapenaeus affinis، ميگوي ژاپني Marsupenaeus japonicas ، ميگوي دم قرمز Fenoro penaeus penicillatus ميباشند از ايستگاههاي مورد نظر (270 نمونه) در درياي عمان و خليج فارس جمعآوري و شناسايي شدند، سپس DNA آنها استخراج شده و بعد از انجام PCR، محصول بدست آمده با پرايمرهاي اختصاصي تعيينتوالي شد. در نهايت دادههاي بدست آمده با نرمافزارهاي فيلوژني آناليز شدند. همچنين جمعيت دو گونه ميگوي ببري سبز Penaeus semisulcatus و ميگوي سفيد Metapenaeus affinis به ترتيب با روش RFLP ژن COI و تعيين توالي 16SrRNA مورد بررسي قرار گرفت. نتايج بدست آمده نشان ميدهند كه ژن COI ميتوكندريايي ماركر مناسبي براي تفكيك گونهها ميباشد و مطابق انتظار، قابليت تفكيك افراد گونهها را از هم دارا ميباشد. از دستاوردهاي اين مطالعه اين است كه گونه penicillatus كه بر اساس صفات مورفولوژيكي در جنس penaeus جاي گرفته بود قرابت بيشتري با گونههاي جنس Marsupenaeus از خود نشان داده است كه اين مطلب براي اثبات نيازمند بررسيهاي بيشتر ميباشد. همچنين مطالعات جمعيتي دو گونه منتخب، كمك شاياني است براي اتخاذ تصميمات مديريتي در جهت حفظ جمعيتهاي متنوع اين دو گونه.
چكيده انگليسي :
Abstract
Barcodes are short segments of DNA that can be used to uniquely identify an unknown specimen to species, particularly when diagnostic morphological features are absent. These sequences could offer a new forensic tool in plant and animal conservation especially for endangered species. Ideally, barcodes could be used to positively identify illegally obtained material even in cases where diagnostic features have been purposefully removed or to release confiscated organisms into the proper breeding population.
In the present study molecular data were used besides the morphological ones to introduce a specific barcode for six selected species of Shrimp. Based on the previous phylogenetics study, it has been proved that the mitochondrial COI gene in crustacean is a good discriminative marker at both inter- and intra-specific levels.
In this regard, six species of shrimp (Fenoro penaeus indicus, Fenoro penaeus merguensis, penaeus semisulcatus, Metapenaeus affinis, Marsupenaeus japonicas, Fenoro penaeus penicillatus were collected from the Persian Gulf and Oman sea. After identification, the total DNA was extracted; COI gene was first amplified and then sequenced for each species. Finally the collected data were analyzed with the specific phylogenetic software. Molecular analysis revealed some degree of interpopulation differences but six good species were recognizable based on COI sequences. Also for population study molecular data of two species Penaeus semisulcatus and Metapenaeus affinis were analysed base on COI RFLP and 16SrRNA sequences respectively. The results would be helpful to protect shrimp species.
كليدواژه :
روش مولكولي (PCR-Sequencing) , بررسي ژنتيك جمعيت , گونه ميگوي تجاري , درياي عمان و خليج فارس , هشت گونه هاي ميگوي دريايي ايران
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
جدول، مصور، نمودار
فروست :
موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 47753
كتابنامه :
كتابنامه: ص. 61- 66
موضوع :
ميگو- پرورش و تكثير , ميگو- پرورش و تكثير , ميگو- صنعت و تجارت , نوكلئوتيدها- توالي , واكنش زنجيره اي پليمراز , ميگو- ايران- درياي عمان- ژنتيك , ميگو- ايران- خليج فارس- ژنتيك