عنوان :
ايجاد جمعيت پايه ژنتيكي قزل آلاي رنگين كمان بر اساس مطالعه تنوع ژنتيكي مولدين اين ماهي با استفاده از ريزماهوارك ها
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
گرجي پور، عين الله
شناسه هاي افزوده :
محقق دولت آبادي، مصطفي ، همكارطرح , ايماني خواه، فرحناز ، همكارطرح , زارع ، رسول ، همكارطرح , ضرغام ،داود ، همكارطرح , كمايي ، كيانوس ، همكارطرح , رزمي، كميل ، همكارطرح , ميثم صلاحي، محمد ، همكارطرح , كريمي، حامد ، همكارطرح ، , نكوئي فرد ، علي ، همكارطرح , مهدوي ، جواد ، همكارطرح , حسيني، احمدرضا ، همكارطرح , گندمكار، حبيب اله ، همكارطرح , مراديان،حسين ، همكارطرح , باشتي، طيبه ، همكارطرح , محمدپور، محسن ، همكارطرح
تنالگان :
وزارت ﺟﻬﺎد ﮐﺸﺎورزي - ﺳﺎزﻣﺎن ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت، آﻣﻮزش و ﺗﺮوﯾﺞﮐﺸﺎورزي - ﻣﻮﺳﺴﻪ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت ﻋﻠﻮم ﺷﯿﻼﺗﯽ ﮐﺸﻮر
چكيده فارسي :
به منظور اجراي پروژه، تعداد 446 نمونه از ماهي قزل الا از 24 مزرعه از استانهاي مختلف كشور جمع آوري گرديد. از هر نمونه 2 تا 3 گرم از باله دمي بريده و پس از تثبيت در الكل اتانول مطلق به آزمايشگاه منتقل گرديد. DNA ژنومي نمونه‌ها از بافت نرم باله ماهي به روش فنل- كلروفرم استخراج و سپس كميت و كيفيت DNA استخراج شده با استفاده از اسپكتروفتومتر و الكتروفورز ژل آگارز 1 درصد تعيين شد. واكنش PCR با استفاده از 10 جفت پرايمر ريزماهواره صورت گرفت. محصول PCR با استفاده از ژل پلي آكريل آميد 6 درصد الكتروفورز و با نيترات نقره رنگ آميزي شد. جهت سنجش وزن مولكولي محصول PCR بر حسب جفت باز (bp) و تعيين ژنوتيپ‌ها از نرم افزار UV Duc استفاده گرديد. مقادير مربوط به فراواني آللي، تعداد آللهاي واقعي و موثر، هتروزيگوسيتي مشاهده شده و مورد انتظار، شاخص شانون، ميزان شباهت و فاصله ژنتيكي, تعادل هاردي- واينبرگ، مقادير FST , RST و جريان ژني بر اساس تست AMOVA با استفاده از نرم افزار ژنتيكي Gene Alex و Popgene محاسبه گرديد. نتايج بدست آمده از اين بررسي نشان مي‌دهد كه 8 جفت پرايمر ميكروستلايتي بررسي شده، پلي‌مورف بودند. در مجموع تعداد 50 الل شناسائي گرديد كه محدوده اندازه آنها بين 280-64 جفت باز بوده است. جايگاه Omyf با 26 آلل داراي بيشترين آلل و جايگاه OTSG 474 و Strurruta58 با 5 آلل داراي كمترين تعداد آلل بود. همچنين هتروزيگوسيتي مشاهده شده (Ho) بين مزرعه نمونه برداري در جايگاههاي ده گانه بين 825/0 تا 964/0 در بررسي تعادل هاردي- واينبرگ مزارع 4،15،18، 20E و 21 در تمامي لوكوس‌ها ي مورد بررسي انحراف از تعادل هاردي– واينبرگ را نشان داده و خارج از تعادل بودند (P<0.05) . در اين بررسي، مزارع 6،7،8،14، در 3 جايگاه در تعادل هاردي واينبرگ بودند و در بقيه جايگاهها خارج از تعادل بودند. ساير مزارع در يك يا دو جايگاه در تعادل بوده و در 8 يا 9 جايگاه خارج از تعادل بودند. نتايج بدست آمده از FST نشان مي‌دهد كه حداكثر آن (24/0) بين نمونه‌هاي مزرعه 1و11 كه داراي كمترين ميزان جريان ژني (7/3) است مشاهده مي‌شود. حداقل FST (04/0) بين نمونه‌هاي مزرعه 8 و9 كه داراي بيشترين ميزان جريان ژني (346) است مشاهده مي‌شود. براساس نتايج حاصل از تست AMOVA بين تمام مزارع با يكديگر اختلاف معني دار مشاهده مي شود (P<0.01) . علاوه بر اين بر اساس معيار Nei (1972) بيشترين فاصله ژنتيكي (89/0) بين نمونه هاي مزرعه 2 با 11 و كمترين شباهت ژنتيكي (15/0) ميان نمونه‌هاي مزارع 3 با 4 وجود دارد. با توجه به داده هاي حاصله بررسي حاضر تنوع ژنتيكي بدست آمده در مزارع پرورشي ماهي قزل الا در كشور قابل توجه بوده و مي تواند به عنوان مطالعه پايه در ايجاد جمعيت پايه در برنامه هاي اصلاح نژادي كمك نمايد.
چكيده انگليسي :
Abstruct:
In order to perform the project, 446 samples of rainbow trout (Onchorhynchus mykiss) from 24 different regions in Iran were collected. About 2-3 g of caudal fin samples was collected from each specimen and preserved in absolute ethyl alcohol and then transferred to the genetic laboratory. Genomic DNA was extracted using the phenol-chloroform method and then DNA content and quality was determined using spectrophotometry and agarose gel electrophoresis, respectively. Polymerase Chain Reaction (PCR) of genomic DNA fin samples was carried out using 10 pairs of microsatellite primers. All PCR products were electrophoresed on 6% polyacrylamide gel and stained with silver nitrate. Following the scoring of alleles, all parameters including allelic frequency, effective number of allele, observed and expected heterozygosity, shanon index, measurement of similarity and genetic distance and Hardy-Weinberg equilibrium, Fst , Rst and gene flow were calculated using AMOVA analysis in the GenAlex and Popgene programs. The results showed that 8 pairs of microsatellite primers were polymorphic. In total, 50 alleles were determined with the range size of 64-280 bp. The locus omyf had maximum number of allele (26) and loci OTSG 474 and Strurruta58 had minimum number of allele (5). The observed heterozygosity was between 0.86 and 0.964. Hardy-Weinberg departure was observed for all loci from farms 18, 15, 4, E20 and 21 and were disequilibrium (P<0.05). The farms 14, 8, 7 and 6 were equilibrium at 3 loci, but showed disequilibrium in other loci. The other farms were equilibrium at 1 or 2 loci and disequilibrium at 8 or 9 loci. The FST results showed that maximum FST (0.24) were between farms 1 and 11in which had minimum of gene flow (3.7). Minimum FST (0.04) were between farms 8 and 9 in which had maximum of gene flow (346). Based on the results of AMOVA analysis, significant differences were detected between all farms (P<0.01). Furthermore, based on Nei 's standard (1972) maximum genetic distance (0.89) were observed between farms 2 and 11 and maximum genetic similarity (0.15) were detected between farms 3 and 4. This result suggests that the unique genetic variation of rainbow trout in hatchery farms of Iran represents a highly valuable genetic resource and provide useful information for creating a based population in the future breeding programs.
كليدواژه :
قزل آلاي رنگين كمان , مطالعه تنوع ژنتيكي مولدين , استفاده از ريزماهوارك ها , ايجاد جمعيت پايه ژنتيكي
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
جدول، مصور، نمودار
فروست :
موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 44575
كتابنامه :
كتابنامه: ص. 52- 54
موضوع :
قزل آلاي رنگين كمان- ژنتيك , قزل آلاي رنگين كمان- اصلاح نژاد , آزادماهيان , قزل آلاي رنگين كمان- پرورش و تكثير , ريزماهوارك ها (ژنتيك)
