عنوان :
تعيين توالي نوكلئوتيدهاي بخشي از ژنوم ميتوكندريال (co1) شش تا هشت گونه ميگوي تجاري خليج فارس و درياي عمان به عنوان خط شناسه گونه هاي ايران به روش مولكولي (PCR-Sequencing)
شرح پديد آور/مجري (مجريان) طرح :
رضواني گيل كلائي، سهراب
شناسه هاي افزوده :
غرقي، احمد ، همكار طرح , تمدني جهرمي، سعيد ، همكار طرح , نياميمندي، نصير ، همكار طرح , مرادي، يزدان ، همكار طرح , سيستاني، محبعلي ، همكار طرح , محبي نوذر، پرويز ، همكار طرح , اسكندري، غلام ، همكار طرح , كرمي راد، ناصر ، همكار طرح , فهيم، آذين ، همكار طرح , لالوئي، فرامرز ، همكار طرح , تقوي، محمدجواد ، همكار طرح , عباسپورنادري، رضا ، همكار طرح , پورغلام، حمزه ، همكار طرح
تنالگان :
وزارت جهاد كشاورزي - سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي - موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
چكيده فارسي :
عبارت است از استفاده از يك توالي كوتاه از يك منطقه استاندارد DNA (DNA barcoding) خط شناسه گذاري ژنوم جهت كمك به تشخيص، تمايز گونهها و تخصيص دادن نمونهها به گونههاي شناخته شده يا جديد. اين يك حوضه علمي كاملاً جديد در زمينه مطالعات تاكسونومي، سيستماتيك و تنوع زيستي موجودات مختلف ميباشد. اين علم جديد داراي اهميت معنيداري در طبقهبندي سريع، دقيق و مطمئن گونههاي متنوع موجودات زنده و مهم از نظر اقتصادي، پزشكي وكشاورزي ميباشد.
در ميان تنوع زيستي چشمگير خليج فارس و درياي عمان، شناسايي سخت پوستان مي تواند يكي از اولويت-هاي نخست باشد. از سوي ديگر، گشتي در پايگاه داده هاي خط شناسه نشان مي دهد كه تاكنون اطلاعاتي كمي از سخت پوستان خليج فارس و درياي عمان در اين پايگاه ثبت شده است.
هدف از انجام اين تحقيق جبران كاستي هاي رده بندي ريخت شناسي و همينطورفراهم آوردن بستري براي برآورد ميزان بومي بودن گونه ها در محيط هاي آبي كشور است با توجه به اينكه كشورهاي خاورميانه فعاليت چنداني در جنبش خط شناسه گذاري نداشته اند، خط شناسه گذاري ميگوهاي خليج فاري و درياي عمان توجيه تاكسونوميك، زيست محيطي، اقتصادي و ملي در بر دارد.
در اين مطالعه شش گونه ميگوي آبهاي خليج فارس و درياي عمان با نامهاي ميگوي سفيد هندي Fenoro penaeus indicus ، ميگوي موزي Fenoro penaeus merguensis ، ميگوي ببري سبز penaeus semisulcatus ، ميگوي سفيد Metapenaeus affinis، ميگوي ژاپني Marsupenaeus japonicas ، ميگوي دم قرمز Fenoro penaeus penicillatus ميباشند از ايستگاههاي مورد نظر (270 نمونه) در درياي عمان و خليج فارس جمعآوري و شناسايي شدند، سپس DNA آنها استخراج شده و بعد از انجام PCR، محصول بدست آمده با پرايمرهاي اختصاصي تعيينتوالي شد. در نهايت دادههاي بدست آمده با نرمافزارهاي فيلوژني آناليز شدند. نتايج بدست آمده از اين مطالعه بسيار جالب توجه بوده و علاوه بر تفكيك افراد يك گونه از ساير گونهها ميزان قرابت گونهها را مشخص ميكند. نكته قابل توجه در اين مطالعه اين است كه گونه penicillatus كه بر اساس صفات مورفولوژيكي در جنس penaeus جاي گرفته بود قرابت بيشتري با گونههاي جنس Marsupenaeus از خود نشان داده است كه اين مطلب براي اثبات نيازمند بررسيهاي بيشتر ميباشد.
چكيده انگليسي :
Barcodes are short segments of DNA that can be used to uniquely identify an unknown specimen to species, particularly when diagnostic morphological features are absent. These sequences could offer a new forensic tool in plant and animal Conservation-especially for endangered species. It was proved that a small fragment of mitochondrial DNA from the 5′-end of cytochrome c oxidase subunit 1 (COI) gene as a reliable, quick and cost-effective identification system for most Crustacea like shrimp. Take a look in DNA barcoding website show that there is a little data about Iranian shrimps which live in Persian Gulf and Oman Sea. In this Study six species of shrimp: Fenoro penaeus indicus, Fenoro penaeus merguensis, penaeus semisulcatus, Metapenaeus affinis, Marsupenaeus japonicas, Fenoro penaeus penicillatus were collected from different stations in Persian Gulf and Oman Sea. All materials were preserved in 70% ethanol and were shipped to the laboratory for taxonomic studies. After identification, the total DNA was extracted; COI gene was first amplified and then sequenced for each species. Finally the collected data were analyzed with the specific phylogenetic software. The results were amazing and the interesting part was that analytical methods for showing species relationship suggested that Fenoro penaeus penicillatus is closer to Marsupenaeus gnus than penaeus gnus. This finding needs more investigation to be proved. We suggest a workflow for DNA barcoding, including database generation and management, which will ultimately be necessary if we are to succeed to join universal DNA barcode for Crustacea.
كليدواژه :
نوكلئوتيدها , ژنوم ميتوكندريال , ميگوي تجاري خليج فارس و درياي عمان , روش مولكولي (PCR-Sequencing)
اطلاعات نشر :
تهران موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور
مشخصات ظاهري :
بخشي رنگي، جدول، مصور، نمودار
فروست :
موسسه تحقيقات علوم شيلاتي كشور 47664
كتابنامه :
كتابنامه: ص. 34- 36
موضوع :
ميگو- پرورش و تكثير , ميگو- صنعت و تجار , ميتوكندري ها , دي. ان. اي ميتوكندري , ميگو- ايران- خليج فارس , ميگو- درياي عمان