عنوان :
مقايسه ويژگي هاي مولكولي و دامنه ميزباني ويروس مولد كوتولگي گال سياه برنج و كوتولوگي زبر ذرت در فارس
پديدآورندگان :
ايزدپناه كرامت اله نويسنده , نوري سحر نويسنده
نام دانشگاه :
دانشگاه شيراز
كليدواژه زبان طبيعي :
ويروس كوتولگي گال سياه برنج كوتولگي زبر ذرت تاكسونومي درخت فيلوژنتيكي گياه شناسي رده كشاورزي
چكيده :
در سالهاي اخير بيماري موسوم به كوتولگي گال سياه برنج )Rice black gall dwarf, RBGD( خسارتهاي فراواني را به شاليزارهاي استان فارس وارد كرده است . علايم بيماري شامل كوتولگي شديد و تشكيل گالهاي كشيده در پشت برگها است . ويروسي ايزومتريك شبيه ريوويروس ها با بيماري همراه است . اين ويروس ها با زنجرك Laodelphax Striatellus منتقل مي گردد. اين ويروس با ويروس كوتولگي زبر ذرت در ايران )MRDV-1( و كوتولگي رگه سياه برنج )RBSDV( رابطه ي سرولوژيكي دارد، لكن بر اساس بيولوژيكي و سرولوژيكي تعيين رابطه ي دقيق آنها ميسر نيست . لذا به منظور تعيين مشابهت دو ويروس كوتولگي گال سياه برنج و كوتولگي زبر ذرت ترادف نوكليوتيدي قسمتي از ژنوم اين دو ويروس تعيين و با هم و همچنين با ساير ترادفهاي موجود در بانك ژن مقايسه گرديد. همچنين اين دو ويروس از نظر علايم ايجاد شده در ميزبان ها با هم مقايسه شدند. به منظور مقايسه ي مولكولي ، dsRNA از بافت ريشه ي برنج و ذرت آلوده با استفاده از كروماتوگرافي با سلولز CF-11 استخراج شد. قطعه هاي dsRNA از ژل آگاروز به وسيله ي Kit DNA Extraction )Cinagen( جدا شدند. آزمون RT-PCR با استفاده از آغازگرهاي تصادفي K1 و K2 انجام شد. محصول PCR با استفاده از T/A clone PCR Product cloning Kit Ins )Fermentas( در پلاسميد pTZ75R/T وارد و در سويه DH5 آلفا از باكتري E.coli همسانه سازي شد. پس از تعيين ترادف قطعات 10-6 ويروس مولد كوتولگي گال سياه و زبر ذرت و همچنين مقايسه ي ترادفها، همرديف سازي چندگانه با ترادف ساير فيجي ويروس هاي موجود در بانك ژن با برنامه W و Clustal X انجام گرفت ...
