عنوان :
مقايسه مولكولي جدايه هاي ويروس كوتولگي زرد جو )BYDV-PAV( در استان هاي مركزي و جنوبي كشور
پديدآورندگان :
افشاريفر عليرضا نويسنده , پاكدل آرزو نويسنده
نام دانشگاه :
دانشگاه شيراز
كليدواژه زبان طبيعي :
كوتولگي زرد جو واكنش زنجيره اي پليمراز تعيين ترادف تنوع ترادف تنوع ژنتيكي رده كشاورزي كشاورزي
چكيده :
ويروس هاي كوتولگي زرد جو يكي از مهمترين ويروس هاي غلات در دنيا مي باشند. بررسي هاي انجام شده بيانگر پراكنش ويروس هاي كوتولگي زرد جو )BYDVs( و غلات )CYDV( در كشور و غالب بودن BYDV-PAV مي باشد. اما اطلاعات كاملي از تنوع ژنتيكي اين ويروس در دست نمي باشد. به منظور بررسي تنوع مولكولي جدايه هاي مختلف PAV در استان هاي مركزي و جنوبي كشور، قسمت هايي از ژنوم شامل پروتيين پيوسته خواني و پروتيين پليمراز در اين تحقيق مورد مطالعه قرار گرفت . جهت رديابي ويروس در نمونه هاي گندم ، جو و يولاف جمع آوري شده از استان هاي مركزي و جنوبي كشور از آزمون هاي enzyme-linked immunosorbent assay )ELISA( و assay )TPLA( tissue print immuno استفاده گرديد. استخراج آر.ان .اي كل از بافت هاي گياهي آلوده به ويروس با استفاده از كيت (شركت سيناژن ) RNX)-Plus( انجام شد. با استفاده از جفت آغازگرهاي اختصاصي PAV با روش RT-PCR قطعه اي از ژن بليمراز )ORF1( به طول bp 903 و قسمتي از ژن پيوسته خواني )ORF5( به طول bp 575 تكثير گرديد. قطعه هاي تكثير شده با استفاده از )MBI Fermentas(Ins T/A clone PCR Product Cloning Kit در پلاسميد PTZ75R/T وارد و در سويه DH5 آلفا باكتري Escherichia coli همسانه سازي گرديد. آناليز ترادف نوكليوتيدي و اسيدآمينه قسمت تكثير شده ناحيه ORF5 مشخص نمود كه جدايه هاي ايراني شباهت زيادي با جدايه هاي موجود در بانك ژن دارند. اما همرديف سازي چندگانه )multiple alignmet( نشان داد كه ناحيه تكثير شده ORF1 هم در سطح نوكليوتيدي و هم در سطح اسيدآمينه قادر به تفكيك جدايه هاي PAV مي باشد...
