عنوان :
تعيين موقعيت تاكسونوميكي ويروس موزاييك اقليد گندم
پديدآورندگان :
ايزدپناه كرامت اله نويسنده , رستگار مريم نويسنده
نام دانشگاه :
دانشگاه شيراز
كليدواژه زبان طبيعي :
فيلوژنتيك تاكسونومي ويروس موزاييك گندم رده كشاورزي كشاورزي
چكيده :
از واكنش زنجيره اي پلي مراز با آغازگرهاي تصادفي )random-PCR( و سپس اتصال قطعات تعيين ترادف شده جدا از هم از طريق طراحي آغازگرهاي اختصاصي ، براي تعيين ترادف ويروس موزاييك اقليد گندم )WEqMV( استفاده شد. بدين ترتيب ترادف كامل ژنوم و نواحي ترجمه نشدني )UTR( ابتدايي و انتهايي ژنوم به دست آمد و مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت . اندازه آر.ان .اي ژنومي ويروس موزاييك اقليد گندم (منهاي دنباله )PolyA برابر 9636 نوكليوتيد است كه 137 نوكليوتيد آن مربوط به -UTR 5 و 172 نوكليوتيد آن مربوط -UTR 3 است . ژنوم WEqMV يك پلي پروتيين بزرگ كد مي كند و سازمان آن مشابه بقيه اعضاي تيره Potuviridae و سايت هاي برشي آن بسيار مشابه ويروس هاي جنس Tritimovirus است . هم رديف سازي دوتايي و چندتايي و تجزيه و تحليل درخت فيلوژنتيك نشان داد كه ويروس موزاييك اقليد گندم ، گونه اي جديد در جنس Tritimovirus است . در مقايسه ژنوم كامل WEqMV و ويروس موزاييك رگه اي گندم )WSMV( 56/8 درصد تشابه نوكليوتيدي و 50/7 درصد تشابه آمينواسيدي وجود دارد و با دو عضو ديگر جنس Tritimovirus يعني Mottle Virus Oat necrotic و Brome Streak Mosaic Virus به ترتيب 57/2 درصد و 52/5 درصد تشابه نوكليوتيدي و 50/6 درصد و 45/5 درصد تشابه آمينواسيدي وجود دارد. در مقايسه WEqMV و WSMV واگراترين نواحي ، P1 و CP (به ترتيب با 51/1 و 51/2 درصد تشابه نوكليوتيدي ) است و بيشترين تشابه در نواحي NIb و HC-Pro (به ترتيب با 63/2 و 60/8 درصد تشابه نوكليوتيدي ) وجود دارد WEqMV . با بقيه اعضاي تيره Potyviridae رابطه دورتري دارد.
