محاسبه تشريك مساعي پيوندهاي هيدروژني در ساختار پلي آلانين آلفاهليكس

Cooperativity calculations of hydrogen bonds in polyalanine alphahelix

با استفاده از نظريه تابعي چگالي به مطالعه اثر تشريك مساعي(cooperativity) پيوندهاي هيدروژني در ساختار پلي آلانين آلفاهليكس ميپردازيم. ساختار پلي- آلانين آلفاهليكس اين مزيت را در بر دارد كه ميتوانيم برهمكنش پپتايد-پپتايد در ساختارهاي پروتييني را نيز به حساب بياوريم. بر اساس نتايج بدست آمده ديده مي شود كه تشريك مساعي باعث ميگردد پيوندهاي هيدروژني در يك زنجيره پپتايد نسبت به يك تك پيوند هيدروژني با قدرت دو برابر همديگر را تقويت مي كنند.

In this paper we use the density functional theory to calculate the cooperativity of hydrogen bonds in the polyalanine α -helix. We choose this structure for accounting the full peptide-peptide interactions. Based on the results, we find that hydrogen bonds strengthen each other by more than a factor of two in the infinite chain