باز شدن نوكلئوزوم در حضور نيروي خارجي

Nucleosome Unwrapping under an External Force

در سلولهاي يوكاريوتي DNA حول هسته هاي پروتئيني مي پيچد و تركيب هاي نسبتا پايداري به اسم نوكلئوزوم مي سازد. با وجود چنين ساختار هايي، اين سوال در ذهن تداعي مي شود كه ژن كد شده بر روي DNA چگونه در دسترس پروتئين هاي مختلف قرار مي گيرد. يك پاسخ براي اين سوال باز شدن موضعي DNA از دور هسته هاي پروتئيني است. در اين مقاله با ارائه ي يك مدل ساده بر پايه ي هندسه ي سيستم و با ادغام آن با يك مدل سينتيك، ديناميك باز و بسته شدن DNA حول هسته هاي پروتئيني در يك نوكلئوزوم را بررسي مي كنيم. نتايج به دست آمده از مدل مطابقت خوب با داده هاي آزمايشگاهي دارند.

DNA accessibility in the nucleosome is one of the questions come into mind knowing the fact that three-quarters of eukaryotic DNA are wrapped in nucleosomes. One answer to this question would be partial unwrapping of the nucleosomal DNA. Here we introduce a theoretical model to justify the known experimental data on this issue, using the geometry of the system. The results are consistent with the experimental data, showing the abilities of the model