بررسي گوناگوني ژنتيكي جدايه‌هاي ازتوباكتر به روش PCR-RFLP

Study on genetic diversity of Azotobacter isolates by PCR-RFLP

براي جداسازي و بررسي گوناگوني ژنتيكي ازتوباكترها به شيوه PCR-RFLP، در آغاز از خاك هاي شهرهاي تبريز، اردبيل و گيلان كه داراي كاربري گوناگون بودند، نمونه‌برداري شد. در اين پژوهش پس از جداسازي باكتري هاي وابسته به جنس ازتوباكتر، نزديك به 30 باكتري براي بررسي بيشتر از ديدگاه الگوي برش قطعات فراوان شده ژن رمز كننده‌ 16S rRNA انتخاب شد. با بهره‌گيري از آغازگرهاي عمومي 24F/ 1525R ژن رمزكننده 16S rRNA فراوان شد. سپس چندريختي (پلي‌مورفيسم) در ازاي تكه هاي برش يافته اين ژن با آنزيم‌هاي برشي HindIII و MspI بررسي شد. يافته‌هاي شناسايي مولكولي باكتري‌ها نشان داد كه افزون بر باكتري‌هاي ازتوباكتر، باكتري‌هايي از جنس‌هاي ديگر مانند كلبسيلا، بيجرينكيا، سودوموناس، ريزوبيوم و اگروباكتريوم نيز در جدايه ها هستند. گرچه همه ازتوباكترهاي شناسايي شده از گونه ازتوباكتر كروكوكوم بودند، ولي از ديدگاه الگوي برش، گوناگوني ژنتيكي در ميان آن ها ديده ‌شد، به گونه‌اي كه همگي در يك گروه نبودند و در سه گروه ديده شدند. گذشته از آن اين بررسي نشان داد كه از ديد ماركر PCR-RFLP ازتوباكترها با باكتري هايي از جنس‌هاي ديگر مانند سودوموناس، بيجرينكيا و كلبسيلا نيز نزديكي فيلوژنتيكي دارند.