بررسي برهمكنش داروي ايندومتاسين با پروتئين آلبومين سرم انساني با استفاده ازشبيه سازي ديناميك مولكولي و مقايسه آن با نتايج تجربي

در اين تحقيق با بررسي برهمكنش داروي ايندومتاسين با پروتئين آلبومين سرم انساني با استفاده از روش محاسباتي شبيه سازي ديناميك مولكولي و كالريمتري تيتراسيوني هم دما، ميزان پايداري و تغييرات ساختاري پروتئين مورد مطالعه قرار داده شده است. با استفاده از روش كالريمتري تيتراسيوني هم دما ميزان ثابت اتصال براي تشكيل كمپلكس آلبومين سرم انساني با ايندومتاسين k= 9.12×10 -3 بدست آمد. شبيه سازي ديناميك مولكولي به كمك نرم افزار گرومكس با نسخه 4.6.1 بر روي ساختار كريستالي آلبومين سرم انساني كه حاوي دو مولكول ايندومتاسين بود، انجام شد. پارامترهاي ترموديناميكي از جمله انرژي آزاد اتصال دارو به پروتئين، براي هر دو مولكول بدست آمد، كه منفي¬تر بودن مقدار انرژي آزاد اتصال مولكول دوم واقع در زير دومين IIA نسبت به مولكول اول واقع در زير دومين IB نشان ميدهد كه اين اتصال پايدارتر بوده و نقش مهمتري را در مطالعه برهمكنش داروي ايندومتاسين با پروتئين آلبومين سرم انساني خواهد داشت. همچنين اين نتايج در توافق خوبي با نتايج حاصل از كالريمتري تيتراسيوني همدما مي¬باشد.