شماره ركورد كنفرانس :
4109
عنوان مقاله :
روشي مبتني بر الگوي ماركف پنهان دوطرفه براي شناسايي مناطق اصلاح شده هيستوني
پديدآورندگان :
محمدي نوري مينا استاد گروه آمار و علوم كامپيوتر، دانشگاه تهران , پزشك حميد استاد گروه آمار و علوم كامپيوتر، دانشگاه تهران
كليدواژه :
تنظيم بيان ژن , اثرات متقابل پروتئين-DNA , روش ChIP , روش ChIP-seq , الگوي ماركف پنهان دوطرفه.
عنوان كنفرانس :
يازدهمين سمينار ملي احتمال و فرآيندهاي تصادفي
چكيده فارسي :
تنظيم بيان ژن شامل طيف گستردهاي از مكانيسمهايي است كه در سلول براي ساماندهي فرآوردههاي ژن استفاده ميشود. مطالعه اثرات متقابل پروتئين- DNA نقش مهمي در درك و تحليل آن دارد. روش ChIP-seq يك روش آزمايشگاهي براي بررسي تعامل بين پروتئين و DNAاست. در اين مقاله الگوهاي موزائيك و الگوي موزائيك-HMM را براي به حساب آوردن اريبيهاي موجود در روش ChIP-seq بررسي ميشوند و سپس الگويي را معرفي ميكنيم كه تركيبي از الگوي موزائيك و الگوي ماركف پنهان دوطرفه است و نتايج دقيقتري نسبت به الگوهاي قبلي ارائه ميكند. براي مقايسه كارائي الگوهاي ارائه شده مطالعات شبيهسازي بر روي دادههاي كروموزوم 21 انجام شده است.