شناسايي فرم هاي مختلف آللي در pri-mir ميكرو آر ان آ bta-mir-152 در گاوهاي نژاد هلشتاين و مونبليارد

Detection of polymorphism in pri-mir of micro RNA beta mir-152 in Holstein Friesian and Montbeliarde cattels

ميكرو‌آر‌‌ان‌آ‌ها، RNA‌ هاي غير‌كد‌كننده‌ي كوچكي هستند كه در بسياري از پاسخ‌هاي فيزيولوژيكي و پاتولوژيكي نقش دارند. ميكرو آر ان آ bta-mir-152 با تنظيم بيان ژن PTGS2 كه در مسير‌هاي متابوليسمي اسيد‌هاي چرب موجود در سلول‌هاي اپيتليال پستاني گاو‌ها نقش كليدي دارد، نقش مهمي را در ميزان چربي شير ايفا مي كند. لذا اين پژوهش با هدف بررسي فرم هاي مختلف آللي در mir pri- ميكرو آر ان آ bta-mir-152 در گاوهاي نژاد هلشتاين و مونبليارد صورت گرفت. در اين مطالعه از 200 راس گاو هلشتاين و 100 راس گاو مونبليارد به صورت تصادفي خونگيري انجام و DNA نمونه ها با استفاده از كيت استخراج گرديد. سپس يك جفت آغازگر اختصاصي براي تكثير قسمتي از pri-mir-152 به طول 441 جفت باز، با نرم افزار Oligo7 طراحي شد. پس از تكثير PCR، تعيين ژنوتيپ نمونه ها با روش SSCP انجام شد. نتايج حاصل از برآورد فراواني هاي ژني و ژنوتيپي با نرم افزار POPGEN وجود دو آلل A و B و دو ژنوتيپ AA و AB را در جايگاه نشانگر pri-mir-152 نشان داد.

Micro RNAs are small noncoding RNAs that contribute to many physiological and pathological responses. Bta-mir-152 plays a significant role in the fat content of the milk by regulating the expression of the PTGS2 gene, which plays a key role in the metabolic pathways of fatty acids in the epithelial cells of the cattle breast. Therefore, the aim of this study was to investigate polymorphisms in pri-mir-152 in Holstein Friesian and Montbeliarde cattles. In this study, blood samples were randomly taken from 200 Holstein and 100 Montbeliarde cattles and DNA samples were extracted. One-percent agarose gel was used to determine the DNA quality. A fraction of pri-mir microRNA bta-mir-152 was amplified using polymerase chain reaction and PCR products were analyzed by SSCP method. PCR products were detected by electrophoresis with 10% polyacrylamide gel and silver nitrate staining. SSCP results of PCR products showed 2 alleles of A and B and 2 genotypes of AA and AB in pri-mir of micro RNA beta mir-152 marker site..