شماره ركورد كنفرانس :
4227
عنوان مقاله :
پيش‌بيني عمق آمينواسيدها در توالي پروتئين با رويكرد يادگيري ماشين
پديدآورندگان :
وثيقي مهدي vasighi@iasbs.ac.ir تحصيلات تكميلي در علوم پايه زنجان; , شبيهي محمد عباس m.abbasshabihi@iasbs.ac.ir تحصيلات تكميلي در علوم پايه زنجان;
كليدواژه :
بيوانفورماتيك , توالي پروتئين , عمق آمينواسيد , ماشين بردار پشتيبان.
عنوان كنفرانس :
چهارمين كنفرانس ملي پژوهش هاي كاربردي در مهندسي كامپيوتر و پردازش سيگنال - cesp95
چكيده فارسي :
عمق آمينواسيد پارامتري است كه به طور غير مستقيم ميزان قرار گرفتن يك آمينواسيد در معرض حلال را نشان مي‌دهد و اطلاعات به‌دست آمده همبستگي بالايي را با اطلاعات مربوط به سطح دسترسي قسمت‌هاي مختلف مولكول دارا مي‌باشد. اين اطلاعات بيانگر محل قرارگيري آمينواسيد در فضاي ساختاري پروتئين مي‌باشد. پيش‌بيني عمق آمينواسيدها با دقت بالا اهميت و كاربردهاي فراواني در شاخه بيوانفورماتيك ساختاري دارد. در اين پژوهش روشي مؤثر با استفاده از ماشين بردار پشتيبان، جهت تعيين رابطه بين توالي و عمق آمينواسيدها معرفي شده است. در روش پيشنهادي از هشت نوع متفاوت ويژگي كه از روش‌هاي متفاوت كد كردن به‌دست مي‌آيند جهت نمايش توالي پروتئين به صورت سيگنال عددي استفاده مي‌گردد. همچنين عمق آمينواسيدها در چهار بازه‌ي سطحي، نيمه‌سطحي، مياني و عميق در نظر گرفته شده است. با توجه به ويژگي‌هاي مربوطه و بازه‌هاي تعريف شده براي عمق آمينواسيد، مدلي جهت طبقه‌بندي آمينواسيدها در يك رشته پروتئيني ساخته شد. دقت كلي روش پيشنهادي براي چهار بازه عمق تعريف شده برابر با 2/62 درصد به‌دست آمد. بهبود قابل توجه نتايج به‌دست آمده نسبت به روش‌هاي پيشين نشان از قدرت بالاي روش پيشنهادي در پيش‌بيني و بكارگيري ويژگي‌هاي مناسب جهت ساخت مدل طبقه‌بندي مي‌باشد.
