ژنوتايپينگ ايزوله هاي اسينتو باكتر بوماني با استفاده از تكنيك Random Amplified Polymorphic DNA-PCR (RAPD-PCR)

اسينتو باكتر بوماني پاتوژن مهم بيماري هاي عفوني بيمارستاني مي باشد. و به اغلب به آنتي بيوتيك ها مقاوم بوده اين ارگانيسم به طور معمول بيماران بستري شده در بيمارستان كه بسيار آسيب پذير هستند و آن‌هايي كه در پوست شان آسيبي ايجاد شده و يا در مسير تنفسي شان اختلال دارند، را مورد هدف قرار مي‌دهد (1). جهت كنترل گسترش اسينتو باكتر در بيمارستانها، مشخص كردن مخزن ارگانيسمها و طريقه انتقال آنها الزامي ميباشد. جهت طراحي استراتژي هاي موثر در كنترل عفونت ناشي از اين باكتري از تكنيك هاي فنوتيپي و ژنوتيپي استفاده مي شود . از تكنيك هاي فنوتيپي مي توان به بررسي خصوصيات بيوشيمايي، فاژتايپينگ، باكتريوسين تايپينگ، ايمنو بلاتينگ ، آناليز پروتئيني و تعيين الگوهاي مقاومت ضد ميكروبي اشاره نمود. اين تكنيك ها در تفكيك و تمايز سويه هاي قدرت مناسبي ندارند و نمي توانند منبع و چگونگي انتشار و راه هاي موثردر كنترل انتشار عفونت و ايزوله هاي شايع را رديابي نمايند. كه براي مطالعه بيشتر در مورد اين تكنيك ها بايد به مطالعه اي كه توسط برزين -برگوگنه و تاور انجام شد مراجعه كرد (2). اين مطالعه بسياري از سيستم هاي مولكولي تايپينگ نظير تعيين خصوصيات پلاسميد ، ريبوتايپينگ، PFGE ، آناليز روش هاي انگشت نگاري ژنوميك با دقت بالا , AFLP PCR ژن اينتگراز و اخيراMLST را نيز شامل مي شود (3). از تكنيك هاي ديگر، DNA چند شكلي تكثير يافته تصادفي (RAPD-PCR) را مي توان اشاره نمود. توالي هاي تكراري بين ژني كه عناصر متقارن خوانده مي شوند. اغلب در بخش هاي غير كد شونده DNA ديده مي شوند. با توجه به تعداد و طول متغيير اين توالي هاي تكراري بين ژني در هر سويه با طراحي پرايمر مناسب و انجام PCR ، تعداد باندهايي كه براي هر ايزوله بدست مي آيد متغير بوده و بنابراين بر اساس تنوع باندها سويه ها گروه بندي مي شوند.