مقايسه تكنيك هاي REP-PCR و ERIC-PCR جهت دسته بندي ايزوله هاي اسينتو باكتر بوماني

اسينتو باكتر بوماني، پاتوژني فرصت طلب كه مهم ترين باكتري جهت ايجاد عفونت بيمارستاني مي باشد قدرت بيماري زايي ميباشد. اين باكتري عامل افزايش عفونتهاي بيمارستاني ميباشد. توانايي اين ارگانيسم براي دست يابي به مكانيسم‌هاي متفاوتي از مقاومت و نيز مقاوم شدن بعضي از سويه‌ها به تمام آنتي بيوتيك‌هاي رايج قابل دسترس و هم چنين فقدان داروهاي ضد ميكروبي جديد و موثر از مهم ترين علل ايجاد كننده خطر در اين باكتري مي‌باشند. علاوه بر روش هاي مرسوم ميكروبيولوژي در تعيين فنوتيپ اين باكتري امروزه از روش هاي مختلف ژنتيكي جهت شناسايي و دسته بندي ايزوله هاي اسينتوباكتر بوماني استفاده مي شود (1). در نهايت تمام روش هاي ژنتيك مولكولي براي متمايز ساختن انواع زير مجموعه ي ارگانيسم بر اساس تفاوت ها در توالي DNA است . بنابراين ، منطقي است كه توالي DNA بهترين نظريه براي متمايز ساختن انواع زير مجموعه باشد (2). مطالعه حاضر با هدف مقايسه دو تكنيك (PCR-Rep) يا توالي هاي تكراري حفاظت شده در ژنوم باكتري و تكنيك (ERIC-PCR) يا به عبارتي واكنش زنجيره اي پلي مراز مبني بر توالي هاي تكراري حفاظت شده درون ژني در خانواده انتروباكترياسهجهت دسته بندي ژنتيكي ايزوله هاي اسينتو باكتر بوماني جدا شده از نمونه هاي خون مي باشد. از جمله روش هايي كه جهت تمايز سويه هاي باكتريايي مورد استفاده قرارمي گيرد و برمبناي PCR است روش ERIC مي باشد اين روش مشابه روش REP-PCR است با اين تفاوت كه واكنش زنجيره اي پلي مراز مبني بر توالي هاي تكراري حفاظت شده درون ژني در خانواده انتروباكترياسه مي باشد. خانواده هاي مختلف توالي هاي تكراري در ژنوم گروه هاي گوناگون باكتري ها پراكنده شده اند، سه خانواده از توالي هاي تكراري بيشتر از بقيه مورد مطالعه قرار گرفته اند كه شامل توالي پاليندروميك تكراري خارج ژني (REP) با اندازه 33-40 bp، توالي داخل ژني تكراري انتروباكترياسه (ERIC) با اندازه 124-127 bp و ( BOX elements) با اندازه 154 bpمي باشد. كه علت انتخاب اين دو روش جهت مقايسه بود.