آناليز بيوانفورماتيكي hsp70 در نشخواركنندگان

پروتئين هاي شوك حرارتي خانواده چند ژني هستند كه اندازه مولكولي آن ها از 10 تا 150 كيلودالتون است و در تمام سلول ها يافت مي شوند؛ اين پروتئين ها به شدت نقش حفاظتي دارند و براي زنده ماني سلول هاي موجودات زنده ضروري هستند. در ميان تمام پروتئين هاي شوك حرارتي ؛پروتئين شوك حرارتي 70 بيشترين بيان را در پاسخ به استرس گرمايي دارد. هدف از اين بررسي شناسايي تفاوت هاي بين گونه ايي مي باشد.به اين منظور تعداد 14 توالي از اين ژن جهت بررسي شباهت ها و تفاوت هاي ژنتيكي بين 4 تا از حيوانات مزرعه ايي استفاده شد. سپس با استفاده از نرم افزارهاي بيوانفورماتيكي مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. نتايج آناليز باعث شناسايي 71 جهش شد كه منجر به ايجاد 13 هاپلوتايپ با تنوع هاپلوتيپي 989/0 در گونه هاي مورد مطالعه شد. تنوع نوكلئوتيدي 01178 /0 و ميانگين تفاوت نوكلئوتيدي k=22.692بود.آناليز تنوع ژنتيكي نشان داد كه بز بيشترين تنوع نوكلئوتيدي را در بين گونه هاي مورد مطالعه داشت؛ همچنين بررسي درخت فيلوژنتيكي نشان داد كه گونه گاو و گاوميش جدمشترك نزديك به هم دارند. با توجه به تنوع بالا ژن hsp70 در ميان گونه هاي مورد بررسي مي توان نتيجه گرفت كه اين تنوع مي تواند دليلي بر تفاوت مقاومت به استرس هاي گرمايي در بين دام هاي مورد مطالعه باشد.