شماره ركورد كنفرانس :
4376
عنوان مقاله :
تنوع ژنتيكي جدايه‌هاي Paecilomyces formosus با استفاده از ريزماهواره‌هاي شناسايي شده از ژنوم Byssochlamys spectabilis
پديدآورندگان :
رستمي فاطمه Fatemehrostami66@gmail.com دانشجوي دكتري بيماري شناسي گياهي دانشگاه زابل؛ , صباغ سيد كاظم Fatemehrostami66@gmail.com دانشيار گروه زيست شناسي دانشكده علوم دانشگاه يزد؛ دانشجوي دكتري بيماري شناسي گياهي دانشگاه زابل؛ , پنجه كه ناصر naserpanjehkeh@uoz.ac.ir دانشيار گروه گياه پزشكي دانشگاه زابل؛ , پيرنيا مهدي pirnia@uoz.ac.ir استاديار گروه گياه پزشكي دانشگاه زابل؛
كليدواژه :
چند شكلي , SSR , جاكارد , آناليز خوشه‌اي
عنوان كنفرانس :
اولين كنفرانس بين المللي يافته هاي نوين در بيوتكنولوژي
چكيده فارسي :
توالي‌هاي ريزماهواره (SSR)، نشانگرهاي مولكولي مهمي براي طيف گسترده‌اي از برنامه‌هاي كاربردي مانند نقشه برداري ژنوم، شناسايي و تنوع ژنتيكي مي‌باشند. با افزايش در دسترس بودن اطلاعات توالي ژنوم، امكان استفاده‌‌ي بيشتر و بهتر از نشانگر SSR فراهم گرديده است. در اين پژوهش ژنتيكي، جدايه‌هاي قارچ Paecilomyces formosus متعلق به دو استان با استفاده از نشانگر ريز ماهواره مورد بررسي قرار گرفت. نمونه‌برداري به صورت تصادفي از 11 منطقه استان‌هاي يزد و خراسان رضوي انجام گرفت و در نهايت تعداد 50 جدايه براي مطالعات بعدي مورد استفاده قرار گرفت. از الگوي توالي پيش فرض ژنوم Byssochlamys spectabilis No.5 براي تعيين توالي ريزماهواره‌ها با استفاده از نرم‌افزار Primer3 استفاده و در نهايت آغازگرها بر اساس نواحي كناري ريزماهواره‌ها طراحي شدند. از تعداد 20 آغازگر طراحي شده، تعداد 5 آغازگر با توانايي تكثير قطعه مورد نظر انتخاب گرديد. مطالعه تنوع ژنتيكي جدايه‌ها با استفاده از نشانگر SSR، درجه بالايي از چند شكلي را در جدايه‌هاي مورد مطالعه نشان داد. تعيين تشابه جدايه با استفاده از ضريب شباهت جاكارد و روش الگوريتم UPGMA انجام شد. كل جدايه‌ها طبق ضريب تشابه جاكارد ( 86 درصد) در 6 گروه ژنوتيپي طبقه بندي شدند. نتايج نشان داد كه آغازگر PVar15 نسبت به بقيه آغازگرها تنوع ژني بالاتري داشته و از نظر تنوع ژنتيكي جدايه‌هاي منطقه سبزوار تفاوت معني داري را نشان دادند.
