طراحي سازه مناسب جهت بيان آر ان اي سنجاق سري ويروسي به منظور ايجاد مقاومت به سه ويروس مهم آلوده كننده كلزا

كلزا از مهمترين گياهان دانه روغني كشور محسوب مي¬شود كه عوامل بيماريزاي مختلفي ¬باعث كاهش عملكرد آن مي¬شوند. شيوع سه ويروس موزاييك شلغم (Turnip mosaic virus, TuMV)، ويروس موزاييك كلم گل (Cauliflower mosaic virus, CaMV) و ويروس زردي غربي چغندرقند (Beet western yellow virus, BWYV) از مزارع كلزاي كشور به طور گسترده گزارش شده است. از اين جهت ايجاد يك لاين مقاوم كلزا از طريق خاموشي آر ان آ و القاي بيان يك آر ان اي سنجاق¬سري كه بتواند در برابر هر سه ويروس از مقاومت قابل توجهي برخوردار باشد اهميت دارد. بدين منظور توالي¬هاي نوكلئوتيدي از ژنوم سه ويروس مذكور، از بانك ژني دريافت شد. سپس به منظور شناسايي مناطق حفاظت شده، براي هر يك از گونه¬ها هم¬رديف سازي توالي نوكلئوتيدي ژن CP با استفاده از برنامه MEGA5 انجام شد. توالي150 نوكلئوتيدي از مناطق حفاظت شده اين ژن از ويروس¬هاي موزاييك شلغم (از نوكلئوتيد شماره 787 تا 937)، ويروس موزاييك كلم¬گل (از نوكلئوتيد شماره 295 تا 445) و ويروس زردي غربي چغندرقند (از نوكلئوتيد شماره 87 تا 237) انتخاب و پس از قرارگيري در كنار يكديگر يك توالي 450 نوكلئوتيدي به دست آمد. جهت بررسي عدم امكان خاموشي آر¬ان¬آ¬هاي ميزبان توالي تركيبي با استفاده از اطلاعات سايت siRNA Scan مورد بررسي قرار گرفت. سپس پيش¬بيني امكان همسانه¬سازي آن در يك ناقل دوگانه مناسب با استفاده برنامه Vector NTI version 8.0 انجام شد. درنهايت امكان بيان ساختار آر¬ان¬اي سنجاق¬سري با استفاده از برنامه RNA structure و سايت RNAfold مورد ارزيابي قرار گرفت. نتايج مطالعات بيوانفورماتيكي اين پژوهش پيش¬بيني كرد كه قابليت بيان آر ان اي سنجاق سري پس از همسانه¬سازي در حامل مناسب و انتقال به كلزا در شرايط آزمايشگاهي وجود دارد.