مقايسه مولكولي دو فيتوپلاسماي متعلق به زيرگروه 16SrII-D با استفاده از آناليز چند قطعه ژنومي

فيتوپلاســماها شــامل پروكاريوتهــاي بــدون ديــواره و بيماريــزاي گياهــي هســتند. امــروزه بــه منظــور شناســايي فيتوپلاســماهاي نزديــك از تــرادف ژنهــاي كمتــر حفاظــت شــده اســتفاده ميشــود. در ايــن مطالعــه قرابــت دو فيتوپلاســماي عامــل فيلــودي خيــار و جــاروك يونجــه ( متعلــق بــه گــروه 16SrII) مــورد بررســي قــرار گرفــت. دو فيتوپلاســماي مذكــور در تــرادف ژن آر.ان.اي ريبوزومــي s16 يكســان، و بــر ايــن اســاس قابــل تفكيــك نبودنــد. بــا طراحــي آغازگــر، ژنهــاي كمتــر حفاظــت شــده SecY و rplV-rpsC در ايــن دو فيتوپلاســماها تكثيــر و تعييــن تــرادف شــد. ترادفهــاي مذكــور بيشــترين شــباهت را بــا ژنهــاي همتــا در فيتوپلاســماهاي زيــر گــروه16SrII-D نشــان دادنــد. بررســيهاي انجــام شــده نشــان از تشــابه بــالاي دو فيتوپلاســماي جــاروك يونجــه و فيلــودي خيــار در ژن SecY (99( /9 و 100 ( rplV-rpsC%( داشــت. در ادامــه بــا طراحــي دو آغازگــر تــرادف قطعــات مربــوط بــه اينترونهــاي موجــود در دو فيتوپلاســما تكثيــر شــد. نتايــج نشــان داد كــه در هــر دو فيتوپلاســما چنديــن كپــي از ايــن قطعــات وجــود دارد. هيــچ محصولــي درPCR گياهــان ســالم توليــد نشــد. همچنيــن تعــدادي از قطعــات مربــوط بــه فيتوپلاســماها تعييــن تــرادف شــد و هويــت فيتوپلاســمايي آنهــا تاييــد شــد. نتايــج الكتروفــورز محصــول بدســت آمــده نشــان داد كــه قطعــات اينترونــي تكثيــر شــده در ايــن دو فيتوپلاســما از نظــر تعــداد و انــدازه متفــاوت اســت. از ايــن نظــر دو فيتوپلاســماي مذكــور قابــل تفكيــك بودنــد. بــر ايــن اســاس عامــل بيماريهــاي جــاروك يونجــه و فيلــودي خيــار يــك اســترين فيتوپلاســما نيســت. در ايــن ارتبــاط عامــل ايــن دو بيمــاري اســترينهاي فيتوپلاســمايي اســت كــه از نظــر ژنتيكــي بســيار بــه يكديگــر شــبيه هســتند. همچنيــن نتايــج ايــن بررســي نشــان دهنــده توانايــي PCR قطعــات مربــوط بــه اينترونهــا بــراي تفكيــك فيتوپلاســماهاي گــروه 16srII اســت.