جداسازي و بررسي ژن‌ AREB به منظور بررسي مقاومت به خشكي گياه فلفل قرمز

فلفل قرمز گياهيست كه به منظور استفاده از ميوه قرمز رنگ آن، با اهداف زيادي ‌از جمله مصرف در صنايع غذايي، رنگ و پزشكي كشت مي شود. به علت با ارزش بودن ميوه اين گياه، شناخت ژن هاي شركت كننده در مسير مقاومت به تنشها از مهمترين مسائل اين گياه است، كه با روشن شدن اين مسير مي توان ابتكار عمل در نظم ميوه دهي و تا حدودي زمان رسيدن محصول و عوامل محيطي موثر بر آن را در دست گرفت. براي كشف و شناخت بهتر از مكانيزم مولكولي موثر در آغاز رشد گياه، به طور اختصاصي ژن و ميزان بيان ژن AREB مورد بررسي قرار گرفت. توالي اين ژن همساني بالايي با اعضاي خانواده جعبه G دارد(از عوامل رونويسي در بيان پروتئين هاي كنترل تنشها) دارند. در اين پژوهش، ژن AREB با استفاده از منابع بيوانفورماتيك، مورد مطالعه قرار گرفت و پرايمرها جهت تكثير اين ژن طراحي شدند. در ادامه، cDNA آن توسط آنزيم رونوشت بردار معكوس ساخته شد و به عنوان الگو براي تكثير ژن AREB در واكنش PCR مورد استفاده قرار گرفت. ميزان بيان ژن AREB در ساقه و ريشه بيشترين و در برگها كمترين مقدار را نشان دادند. طي واكنش PCR قطعه ايي به طول ۹۵۰ جفت باز از cDNA و قطعه اي به طول ۱۳۵۰ جفت باز از DNA ژنومي تكثير يافت. اين ژن، يك پروتئين ۲۲۵ اسيدآمينه اي را رمز مي كند كه داراي منطقه با توالي جعبه G مي باشد. با تجزيه و تحليل ساختار مولكولي پروتئين رونوشت شده و بر اساس مدل سازي همولوژيكي، شكل فضايي آن نشان داد، كه اين پروتئين ساختاري منظم دارد.