شناسايي و توالي‏يابي ژن آنزيم آليناز دخيل در مسير بيوسنتز آليسين به همراه اولين گزارش در تعدادي از گونه‏هاي جنس Allium بومي ايران

سرده سير از جنس گياهان گلدار تك لپه‏اي داراي تركيبات گوگردي است كه از اسيد امينه اي به نام آليين حاصل مي گردد. آليين سوبستراي آنزيم آليناز است كه در اثر فعاليت اين آنزيم به آليسين، پيروات و آمونيوم تبديل مي گردد. اين مطالعه، نخستين گزارش در رابطه با شناسايي و توالي‏يابي ژن آنزيم آليناز دخيل در مسير بيوسنتز آليسين در تعدادي از گونه‏هاي Allium است. تعداد شش گونه (A. stipitatum, A. atroviolaceum, A. fistolosum, A. umbellicatum, A. lenkoranicum Allium rubellam,) از نقاط جغرافيايي مختلف ايران از مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران تهيه شدند. مطالعات روي پنج گونه ديگر (Allium sativum, A. ascalonicum, A. chinensis, A. macrostemon, A. tuberosum) از طريق داده‏هاي SRA انجام گرفت. شناسايي ژن با استفاده از داده‏هاي حاصل از نتايج توالي‏يابي نسل بعدي و سپس توالي يابي با روش سنگر انجام گرديد. قطعه حدود 1500 جفت بازي از ژن آليناز به صورت موفقيت‏آميزي با استفاده از آغازگرهاي طراحي شده تكثير و سپس توالي‏يابي گرديد. طول ORF از 1425 نوكلئوتيد در گونه A. sativum تا 1449 نوكلئوتيد در گونه A. pesoduampeloprasum متغير بود. نتايج مربوط به قطعات توالي‏يابي شده در پايگاه داده‏هاي NCBI GenBank ثبت شدند.