شماره ركورد كنفرانس :
4678
عنوان مقاله :
بررسي تغييرات اپي ژنوم در گياه آرابيدوپسيس (Arabidopsis thaliana) تحت تنش اسمزي
پديدآورندگان :
پناهي رضا rezapanahi@shirazu.ac.ir دانشجوي كارشناسي ارشد پژوهشكده زيست فناوري، دانشكده كشاورزي، دانشگاه شيراز، ايران. , ابراهيمي اسماعيل دانشيار پژوهشكده زيست فناوري، دانشكده كشاورزي، دانشگاه شيراز، ايران , نيازي علي استاد پژوهشكده زيست فناوري، دانشكده كشاورزي، دانشگاه شيراز، ايران , گياهي حسن دانشجوي كارشناسي ارشد پژوهشكده زيست فناوري، دانشكده كشاورزي، دانشگاه شيراز، ايران.
كليدواژه :
ChIP-Seq , تنش‌هاي غير زيستي , تنظيم رونويسي , هستي‌شناسي ژن.
عنوان كنفرانس :
سومين كنگره بين المللي و پانزدهمين كنگره ملي علوم زراعت و اصلاح نباتات ايران
چكيده فارسي :
شرايط خشكي و شوري خاك معمولاً در ابتدا و انتهاي دوره‌ي زندگي گياه اتفاق مي‌افتد و گياه فرصت مناسب براي كامل كردن چرخه‌ي زيستي خود و افزايش تحمل در برابر تنش‌هاي محيطي را پيدا نمي‌كند. تكنيك ChIP-Seq براي درك اثر متقابل ژنوم با پروتئين و بررسي رونويسي RNA پليمراز، تنظيم رونويسي و تغييرات هيستون كاربرد دارد. بررسي كروماتين براي شناسايي و پرورش گياهان مقاوم به تنش‌هاي محيطي مناسب مي‌باشد. به‌منظور شناسايي الگوي تغييرات اپي-ژنوم در پاسخ به تنش اسمزي در گياه آرابيدوپسيس (Arabidopsis thaliana)، داده‌هاي خام ChIP-Seq حاصل از يك آزمايش از بافت ريشه و قسمت هوايي مورد آناليز قرار گرفت. نتايج حاصل از رسم شبكه‌ي ژني ريشه و قسمت هوايي گياه نشان داد كه تحت تنش اسمزي الگوي بيان ژن‌هايي مانند SUP، LFY، WUS و SPL8 در ريشه گياه، بيشتر تغيير كرده كه اين ژن‌ها در گل‌دهي و زودرسي نقش دارند و در قسمت هوايي الگوي بيان در ژن‌هايي مانند STH، CCA1، PIF3 و RGL3 تغيير كرده كه بيشتر در تنظيم ساعت بيولوژيكي گياه و واكنش نسبت به نور ايفاي نقش مي كند. آناليز هستي‌شناسي ژن‌ها در ريشه و قسمت هوايي گياه نشان داد كه تنش اسمزي باعث تغييرات الگوي بيان ژن‌هاي دخيل در فرايندهاي متابوليكي، تنظيم‌كننده‌هاي بيولوژيكي، فرايندهاي سيگنالي و فرايندهاي سلولي مي‌شود.
