شماره ركورد كنفرانس :
4678
عنوان مقاله :
مقايسه پايگاه هاي داده و ابزارهاي محاسباتي براي تجزيه و تحليل داده هاي ژنوميكس و ترانسكريپتوميكس در برخي از گياهان خانواده حبوبات
پديدآورندگان :
امام جمعه عباسعلي استاديار، آزمايشگاه بيوتكنولوژي محاسباتي و بيوانفورماتيك، گروه اصلاح نباتات و بيوتكنولوژي، دانشكده كشاورزي، دانشگاه زابل، زابل، ايران , قاسمي مجتبي دانشجوي دكتري بيوتكنولوژي كشاورزي، گروه بيوتكنولوژي، دانشكده كشاورزي، دانشگاه زابل، زابل، ايران , مزارعي ايوب mazaraie70@gmail.com دانشجوي دكتري بيوتكنولوژي كشاورزي، گروه بيوتكنولوژي، دانشكده كشاورزي، دانشگاه زابل، زابل، ايران
كليدواژه :
ابزارهاي محاسباتي , پايگاه داده , ترانسكريپتوميكس , حبوبات , RNA-Seq
عنوان كنفرانس :
سومين كنگره بين المللي و پانزدهمين كنگره ملي علوم زراعت و اصلاح نباتات ايران
چكيده فارسي :
پايگاه هاي داده حبوبات امروزه ميزبان داده هاي مقياس بزرگ ژنوميكس و ترانسكريپتوميكس هستند. اين پايگاه داده ها ابزارهاي محاسباتي و بيوانفورماتيكي يكپارچه براي مطالعه كاركرد ژن، خانواده ژني و عوامل رونويسي در حبوبات و ساير لگوم ها فراهم مي آورند. اين پژوهش به منظور بررسي و مقايسه تعدادي از مهم ترين و جامع ترين پايگاه هاي داده بيولوژيكي مربوط به تجزيه و تحليل داده هاي ژنوميكس و ترنسكريپتوميكس در برخي از گونه هاي خانواده حبوبات انجام شد. در اين تحقيق تعدادي از پايگاه داده هاي مهم حوزه ژنوميكس و ترنسكريپتوميكس مورد مقايسه قرار گرفتند. نتايج نشان داد، پايگاه داده LegumeTFDB با 59 ارجاع بيش ترين تعداد ارجاعات و پايگاه داده هاي LegumeIP و PvTFDBبه طور مشترك با 3 ارجاع كم ترين تعداد ارجاعات را در مطالعات گذشته نگر داشتند. اگرچه پايگاه داده LegumeIP كم ترين تعداد ارجاعات را داشت ولي در عين حال به عنوان جامع ترين پايگاه داده يكپارچه براي داده هاي مقياس بزرگ بيان ژن مبتني بر روش هاي Microarray و RNA-Seq در خانواده حبوبات معرفي مي گردد.
