شماره ركورد كنفرانس :
4678
عنوان مقاله :
استفاده از آناليز بيوانفورماتيكي به‌منظور بررسي نقش ژن‌هاي هدفmiRNAهاي گوجه فرنگي
پديدآورندگان :
محسني فرد احسان هيات علمي گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشكده كشاورزي دانشگاه زنجان , عزيزي مريم azizi.maryam@znu.ac.ir دانشجوي كارشناسي ارشد گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشكده كشاورزي دانشگاه زنجان , قبولي مهدي هيات علمي گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشكده كشاورزي دانشگاه ملاير،
كليدواژه :
ژن هدف , ساختار ساقه-حلقه , گوجه فرنگي , هستي شناسي ژن
عنوان كنفرانس :
سومين كنگره بين المللي و پانزدهمين كنگره ملي علوم زراعت و اصلاح نباتات ايران
چكيده فارسي :
miRNA ها، RNA هاي كوچك تنظيم كننده اي هستند كه در فرآيند هاي مختلف بيولوژيكي گياه نقش دارند. اين مولكول ها به پروتئين ترجمه نشده ولي در كنترل بسياري از ژن هاي كدكننده پروتئين نقش دارند. در اين مطالعه، miRNAهاي بالغ و پيشساز گوجه فرنگي و ژن هاي هدف آن‌ها مورد بررسي قرارگرفته‌اند. تاكنون در اين گياه 77 پيشساز معرفي‌شده‌اند كه درمجموع 110 miRNA بالغ توليد مي كنند. نتايج بررسي توزيع طول براي ساختارهاي ساقه-حلقه در گوجه فرنگي نشان داد كه 50 درصد ساختارهاي ساقه-حلقه در اين گياه بين 80 تا 180 نوكلئوتيد طول دارند. درمجموع براي همه miRNAها 322 ژن هدف شناسايي شد كه شامل 237 ژن منحصربه‌فرد بود. برخي ژن ها توسط چندين miRNAها به‌عنوان هدف شناسايي مي شوند. عمده ژن هاي هدف از طريق مكانيسم برش توسط miRNAها كنترل مي شوند. آناليز GSEA نشان داد كه ژن هاي هدف miRNAها در بسياري از فرايندهاي حياتي گياه نقش داشته و پاسخ به استرس، اتصال به DNA، فعاليت فاكتورهاي رونويسي، انتقال سيگنال، اتصال به پروتئين و فعاليت كينازها مهم‌ترين فعاليت هاي تحت كنترل miRNAها هستند.
