بررسي اثر متقابل ژنوتيپ و محيط با جانهي داده ژنومي شبيه‌سازي شده

هدف از اين تحقيق ارزيابي مدل¬هاي تك-صفتي و چند-صفتي در سناريوهاي مختلف ژنومي با در نظر گرفتن جانهي جهت برآورد صحت پيش-بيني ژنومي و تشخيص وجود اثر متقابل ژنوتيپ و محيط (G × E) بود. داده‌هاي ژنومي با تعداد متفاوت جايگاه¬هاي صفات كمي (90 و 900) و سطوح مختلف عدم تعادل پيوستگي (كم و زيادLD = ) براي تراكم K50 شبيه‌سازي شدند. سپس به طور تصادفي 90 درصد نشانگرها حذف و در مرحله بعد اين نشانگرها از طريق نرم افزار Flmpute (نسخه 2/2) جانهي شدند. ميانگين صحت جانهي در سناريوهاي با LD زياد و كم به ترتيب 976/0 و 943/0 بود. در همه سناريوهاي شبيه‌سازي شده تفاوت جزئي بين صحت ژنومي داده‌هاي اصلي و جانهي مشاهده شد. صحت ژنومي با كاهش سطح LD، وراثت¬پذيري و همبستگي ژنتيكي بين صفات كاهش يافت.