آناليز هاپلوتيپي ژنهاي متحمل به شوري HvCBL و HvHKT در اكوتيپ هاي جو (.Hordeum sp)

Haplotype analysis of salt tolerance genes HvCBL4 and HvHKT1 for barley ecotypes (Hordeum sp.)

تحقيق حاضر با هدف تعيين تنوع آللي ژنهاي كانديداي تحمل به تنش شوري در اكوتيپ هاي جو در سطح تك نوكلئوتيد SNP جستجوي آللهاي جديدو طبقه بندي ژنوتيپ هاي آزمايشي در قالب گروه هاي هاپلوتيپي و با روش توالي يابي انجام گرفته است. در اين تحقيق از 96 ژنوتيپ جو كه در مناطق مختلف شور در جهان از جمله ايران كشت مي گردند، به عنوان مواد گياهي استفاده گرديد. آناليز هاپلوتيپي ژنهاي HvCBL و HvHKT 1 عدم گروهبندي هاپلوتيپي اكوتيپ هاي مورد آزمايش از نظر ژن HvHKT و وجود سه گروه هاپلوتيپي متشكل از 7 ژنوتيپ را در ژن HvCBL نشان داده است.پنج ژنوتيپ از اين هفت ژنوتيپ متعلق به ايران مي باشند. گروه هاپلوتيپي اول متشكل از سه ژنوتيپ، دو ژنوتيپ ايراني و ديگري رقم شاهد، مي باشد. رقم شاهد در اين تحقيق، رقم كليپر جو، يك رقم بسيار مقاوم به شوري است. بنابراين استنباط مي گردد كه اين دو رقم ايراني داراي سطح بالايي از مقاومت به شوري هستند. همچنين طبقه بندي ژنوتيپ هاي ايراني در گروه هاي مختلف هاپلوتيپي نشان دهنده وجود تنوع ژنتيكي معني دار بين ارقام ايراني است كه داراي اهميت ژنتيكي بسيار زيادي مي باشد زيرا مي توان از آنها به عنوان منابع ژنتيكي جديد براي تحمل به شوري استفاده نمود. آناليز هر دو ژن در ژنوتيپ هاي مورد آزمايش در اين تحقيق وجود رابطه ژنتيكي بسيار نزديك بين ارقام ايراني به استثناي چند مورد را نشان داده است كه دليل آن، منشأ ژنتيكي بسيار متفاوت اين ارقام ايراني بوده است. در بقيه موارد، ارقام قرابت ژنتيكي زيادي با يكديگر داشته و از نظر فنوتيپي نيز سطوح مشابهي از مقاومت به شوري دارند.

Carthamus tinctorius L.cv. MCC The present study performed to determine allele variation in salinity stress tolerance candidate genes of barley ecotypes in single nucleotide polymorphism (SNP) level, Search for new alleles and classification of studied genotypes in haplotype groups by sequencing method. In this study was used of 96 ecotypes of barley that are grown in different areas of passion in the world, including Iran, as plant material. Haplotype analysis of the genes showed that non-grouped ecotypes in terms of HvHKT1geneand three different haplotype groups in gene HvCBL4including seven genotypes. Five of the seven genotypes were Iranian ecotypes. The first haplotype group included three genotypes that two ones belong to Iran and other was control. The control genotype in this study was highly resistance barley variety to salinity stress, Cliper .It is inferred that two Iranian cultivars that grouped with control may have high level salinity tolerance. Classified Iranian genotypes in other different groups of haplotype also showed significant genetic diversity between them which have very great genetic importance. Because they can use as new genetic resources of salinity tolerance. Analysis of both genes in the genotypes tested in this study has shown very close genetic relationship between Iranian genotypes excluding a few cases. The reason is probably very different genetic origins of these Iranian ecotypes. It can be inferred that in other cases, they have high level of genetic affinity .with each other and similar levels of phenotypic resistance to salinity