پيش بيني توليد استات توسط اشريشياكلي با استفاده از يك مدل متابوليكي مقياس ژنوم

با مدل سازي و شبيه سازي عملكرد يك ريزاندامگان مي توان به راهكارهاي بهبود عملكرد سلول دست يافت. دراين تحقيق، با استفاده از ادغام داده هاي بيان ژن با يك مدل متابوليكي مقياس ژنوم، يك الگوريتم به منظور پيش بيني توليد استات و يافتن ژن هاي موثر در توليد آن توسط اشريشياكلي ارائه شده است. الگوريتم توليداستات را در بازده رشد بين0/5و0/18 پيش بيني مي كند و به خوبي مي تواند محدوديت هاي منجر به توليد استات را شناسايي نمايد. نتايج الگوريتم نشان مي دهد كه افزايش بيان سه ژنdld و nfsB ،ndhاز مسير فسفريلاسيون اكسيداتيو بيشترين نقش را در كاهش توليد استات دارد. همچنين كاهش بيان ژن هاي ompFوnfsB و lamB ،ompC موثرتر از ساير ژن ها در كاهش توليد استات است