تجزيه و تحليل RNA هاي كوچك (sRNAs) گندم نان(Triticum aestivum) در پاسخ به آلودگي با قارچ عامل بادزدگي سنبله(Fusarium (graminearum

توالي يابي RNA يا RNA-Seq روشي است كه در سال هاي اخير براي نمايه پايي ترانسكريپتوم توسعه يافته است وامكان شناسايي و نمايه يابي RNA هاي غير كد كننده كوچك را با دقتي بالا و در تعدادي بسيارزياد فراهم آورده است. RNAهاي غيركدكننده كوچك از طريق مكانيسم هاي خاموش كردن ژن طي رونويسي (TGS) يا خاموش كردن ژن پس از رونويسي (PTGS) بيان بسياري ازژن ها را كنترل مي نمايند. در اين پژوهش با استفاده از پايگاه هاي داده ي مربوط به RNA هاي كوچك و ابزارهاي بيوانفورماتيك و با بكارگيري روش هاي آماري، مقايسه دو كتابخانه RNA هاي كوچك مربوط به سنبله گندم در شرايط نرمال (731975 توالي) وآلودگي به قارچ فوزاريوم (1429467 توالي) انجام شد. RNA هاي كوچك با بيان افتراقي بين دو شرايط ، نوع RNA هاي كوچك (miRNAيا siRNA بودن) و حفظ شده با جديد بودن ان ها شناسايي گرديد. ژن هاي هدف برخي از توالي ها كه بيشترين تفريق بيان را نشان داده بودند مشخص شد و شبكه ژني بين آن ها تعيين گرديد. نتايج نشان داد 11446 توالي داراي بيان افتراقي طي آلودگي به قارچ بودند. بررسي ژن هاي هدف و شبكه ژني نيزنشان داد كه عمده ژن هاي هدف از دسته عوامل رونويسي و به خصوص عوامل رونويسي اختصاصي گياهان نظير Squamosa promoter-binding protein-like (SPL) و Homeodomain-leucine zipper (HD-Zip) بودند.