بررسي بيوانفورماتيك ژن سوپر اكسيدديسموتاز در آرابيدوپسيس (Arabidopsisthaliana) و گياه شورپسند Thellungiella halophyla

آنزيم سوپر اكسيد ديسموتاز(SOD) نقش مهمي در برابر تنش هاي اكسيداتيو در گياهان ايفا مي كند. در حاليكه آرابيدوپسيس به عنوان يك گياه مدل گلايكوفيت، براي تشريح مولكولي گياهان شناخته شده است. گياه شورپسند Thellungiella halophyla كه شباهت زيادي به آرابيدوپسيس دارد، به عنوان يك مدل مناسب براي مطالع، پاسخ هاي مولكولي گياهان به شوري در نظر گرفنه شده است. اطلاعات موجود نشان مي دهد كه درتنش شوري بيان ژن SOD در آرابيدوپسيس افزايش نمي يافت در حاليكه اين ژن درT. halophyla به ميزان زيادي افزايش بيان نشان مي داد. اين تحقيق با هدف مقايسه نواحي رمز شونده و پروموتور ژن SOD در دو گياه آرابيدوپسيس و T. halophyla به منظور شناسايي تفاوت هاي احتمالي مرتبط با واكنش متفاوت آنها به شوري انجام شد. دو گياه مورد بررسي ازنظر توالي آمينو اسيدي ژن SOD شباهت زيادي(95%) با يكديگر داشتند. آناليز پروموتور ژن SOD نشان داد كه تعداد كل عناصر سپس در پروموتور ژن SOD آرابيدوپسيس 172 عنصر و در پروموتور ژنSOD گياه T. halophyla 124 عنصر بود. آزمون آماري فيشر نشان داد كه دو پروموتور از نظر تعداد عناصر عملگر سپس TATA-Box و CAAT-Box با هم اختلاف معني داري دارند. همچنين عنصر MRE يكي از عناصر عملگر سپس موثر در پاسخ به تنش كه محل اتصال عوامل رونويسي MYB مي باشد، تنها در ناحيه پروموتوري ژن SOD در گياه T. halophyla مشاهده شد. بنابراين شايد بتوان تفاوت بيان اين ژن در دو گونه مورد بررسي را به برخي عناصر تنظيم كننده سپس موجود در پروموترها مرتبط دانست.