جداسازي و همسانه سازي ژن بيماري زاي pthA در باكتري زانتوموناس آكسنوپوديس پاتووار سيتري

زانتوموناس ها گروهي از باكتري هاي گرم منفي بيماري زاي گياهي هستندو مانند ساير باكتري هاي گرم منفي از سيستم خاصي براي ايجاد بيماري استفاده مي كنند. از آنجايي كه در ايران مركبات يكي از محصولات مهم زيركشت است، بنابراين بايد به طور خاص به بيماري هايي كه مركبات را درگير مي كند توجه كرد. يكي از اين بيماري ها شانكر مركبات مي باشد كه توسط زانتوموناس آكسنوپوديس سيتري ايجاد مي شود. بنابراين در اين پروژه ما براين شديم كه به صورت خاص به اين بيماري بپردازيم و راهكاري مناسب براي مبارزه با آن پيدا كنيم. در اين بيماري باكتري برگ ها، ساقه ها، و ميوه ها را آلوده مي كند. اين بيماري انواع متنوعي دارد. پنج نوع از اين بيماري وجود دارد، كه فرم *A از اين بيماري در ايران مشاهده مي شود. ارتباط بين باكتري هاي گرم منفي بيماري زاي حيواني و گياهي با ميزبانشان بستگي به يك نوع سيستم محافظت شده به نام سيستم ترشح پروتئين نوع سه (TTSS) دارد. كلاستري كه سيستم ترشحي نوع سه را كد مي كند hrp نام دارد. افكتور پروتئين ها به وسيله اين سيستم به داخل سلول گياهي وارد مي شوند. يكي از اين افكتور پروتئين ها پروتئين PthA است كه توسط ژن PthA كد مي شود. PthA اولين عضو خانواده ي avrBs3/pthA مي باشد كه مهم ترين عامل بيماري زاي را نشان مي دهد. هدف از تحقيق حاضر جداسازي و همسانه سازي ژن pthA مي باشد. براي اين منظور ابتدا ترادف كد كننده ي ژن مذكور از منابع بانك ژن استخراج گرديده و پرايمرهاي اختصاصي مربوطه براي جداسازي آن طراحي گرديد. جداسازي و تكثير ژن مربوطه با روش PCR صورت گرفته و به منظور توليد انبوه پروتئين نوتركيب ، همسانه سازي دروكتور بياني صورت پذيرفت. تاييد مراحل جداسازي و همسانه سازي با استفاده از روش هاي تكميلي مولكولي و تعيين ترادف انجام پذيرفت.