بررسي ساختار و عملكرد ژن WRKY57 در آرابيدوپسيس

فاكتورهاي رونويسي، پروتئينهاي تنظيمي در موجودات زنده هستند. خانواده ژني WRKY از فاكتورهاي رونويسي هستند كه نامشان از دمين WRKY گرفته شده است و به نظر مي رسد كه در سازگاري گياهان به تنشهاي محيطي نقش داشته باشند. لوكوس Atlg69310 كدكننده ي پروتئين57 WRKY است. ساختار و عملكرد آن، با استفاده از ابزارهاي بيوانفورماتيكي مورد بررسي قرار گرفت. توسط CD-Search ، دمين WRKY شناسايي شد كه يك دمين متصل شونده به توالي از DNA به نام W box است. فاكتورهاي رونويسي بواسطه اين دمينها بيان ژنهايي را كه در ناحيه پروموتر داراي اين توالي هستند را تنظيم ميكنند. بيان آن در مراحل مختلف نموي و تنش خشحكي و همبياني آن بترتيب توسط پايگاههاي اطلاعاتي efp, genevestigator و ATTED-II بررسي شد. نتايج نشان داد، بيشترين و كمترين ميزان بيان را به ترتيب در برگهاي پير و نوك ساقه دارد. بيان آن در شرايط تنش خشكي در بافت ريشه از ابتداي شروع تنش اما در اندام هوايي پس از 24 ساعت افزايش يافت و با NAC1, MES9, ECT8 و Bzip داراي بيان شمترك است. همولوگهاي اين ژن نيز در گياهان مختلف با استفاده از نرم افزار mega5 مورد مقايسه قرار گرفت. ترسي درخت فيلوژنتيكي نشان داد بيشترين همولوژي را با 57 WRKY احتمالي در انگور دارد. همچنين تعدادي توالي همولوگ در چغندرقند نيز يافت شد. درنتيجه، بررسي اين ژن در چغندرقند هم ميتواند در شرايط آزمايشگاهي مورد آزمايش قرار بگيرد.