اولين گزارش ارپوسيدگي جوانه انتهايي ني(Arundo donax) ناشي از Pectobacterium sp

ني يكي از اعضاي خانواده گندميان( Poaceae) است كه بيشتر در حاشيه مزارع برنج، مردابها و حاشيه رودخانه ها رشدمي كنند. در بهار و اواسط تابستان 1390 تعدادي نمونه با علائم پوسيدگي ساقه و جوانه انتهايي از مازندران جمع آوري شد. از نمونه ها باكتري Pectobacterium sp براساس خصوصيات فنوتيپي شناسايي شد. نمونه ها درتكثير ژن پكتين لياز(Pel) با استفاده از آغازگرY1/Y2 مثبت بوده و به جنس Pectobacterium تعلق داشتند. دو جدايه با استفاده ازآغازگرژن پليمر از ريبوزومي زير واحد بتا (rpoB)تكثير و در هردو جهت سنس وآنتيسنس تعيين توالي شدند. توالي هاي بدست آمده با استفاده از نرم افزار Seqman اصلاح و بابكارگيري نرم افزارBLAST (NCBI) با توالي هاي موجود در بانك ژن هم رديف شدند. توالي هاي ني باديگر توالي ها با استفاده از الگوريتم ClustalWهمرديف شد و به روش Neiborjoining در نرم افزار Mega5.1 دندروگرام مربوطه ترسيم گرديد. نتايج نشان داد كه جدايه هاي ني با گونه هاي مختلف Pectobacterium شباهت داشته ولي بطور قطعي در هيچ گونه شناخته شده اي قرار نگرفت. اين جدايه ها احتمالا متعلق به گونه جديدي از پكتو باكتريوم باشند.