بررسي هم تنظيمي و هم بياني تعدادي از ژن هاي پاسخ دهنده به تنشهاي زيستي و غيرزيستي با ژن LTP در گياه آرابيدوپسيس

چربيها، نقشهاي كليدي مختلفي در مكانيزمهاي درون گياه دارند. LTP: پروتئينهاي كوچك و ضروري در تنشها هستند و مولكولهاي آبسزيك اسيد (ABA) مسئول بيان ژنهاي LTP در مسير سيگنالي است. جهت بررسي هم تنظيمي و هم بياني تعدادي از ژن هاي پاسخ دهنده به تنشهاي زيستي و غيرزيستي با ژن LTP، ژن هاي با بيشترين همبستگي و هم بياني تحت تنشهاي زيستي و غيرزيستي با p.VALUE=0.01 در گياه آرابيدوپسيس با استفاده از پايگاه GENEVESTIGATOR انتخاب گرديدند. نتايج Co-Expression مشخص نمود كه ژن AT2G05520 با ژن LTP5 بيشترين همبستگي را دارد. نتايج Hierarchical Clustering براي ژنهاي هم بيان با ژن LTP5 در بافتهاي گياه آرابيدوپسيس در هر دو شرايط افزايش و كاهش بيان نشان داد كه بيشترين بيان در ساقه است. ژنهاي AT2G03980, AT3G45780, AT3G28040 و AT2G15960 با ژن LTP5 در يك گروه قرار گرفتند. نتايج ماتريس bio-cluster نشان داد كه بيشترين ميزان بيان ژنهاي همبسته در مراحل جوانه زني است و بزرگترين بيوكلاستر مربوط به افزايش بيان، يك ماتريس 5x21 بود. در شرايط تنش زيستي با اعمال p.syringae ، تنش خشكي بعد 24 ساعت، تنش اسمزي و تنش نور بيشترين كاهش بيان را نشان دادند و بزرگترين بيوكلاستر توليد شده مربو ط به كاهش بيان، يك ماتريس 8x12 بود.