مطالعه بيوانفورماتيكي و شناسايي موتيف هاي موجود در پروموتر ژن هاي گيرنده هاي شبه كينازي در آرابيدوپسيس تاليانا

بررسي و شناسايي موتيف هاي شناخته شده در پروموتر ژن هاي مهم و پيش بيني تغيير بيان اين ژن ها تحت تاثير تنش هاي زنده وغيرزنده با استفاده از تكنيك هاي رايانه اي يكي از زمينه هاي جذاب در بيوانفورماتيك است. با استفاده از بانك اطلاعاتي TAIR توالي 10 ژن رمز كننده گيرنده هاي شبه كينازي از آرابيدوپسيس تاليانا جمع آوري و با استفاده از برنامه هاي PlantCARE و AGRIS مورد تجزيه و تحليل قرار گرفتند و موتيف هاي موجود در آنها بررسي شدند. نتايج نشان دادند كه توالي پروموتر اين ژن ها شامل عناصر تنظيمي مختلفي مانند CAAT box TATA box ، ABRE box عناصر پاسخ به زخم، خشكي و غيره است كه باعث القاي بيان ژن هاي رمز كننده گيرنده هاي شبه كينازي در طول رشد و نمو و تحت تنش هاي زنده و غيرزنده مي شود. نتايج اين پژوهش نشان داد كه گيرنده هاي شبه كينازي به احتمال زياد علاوه بر موثر بودن در تحمل به تنش هاي شوري و خشكي، پاسخ به زخم در بسيار ديگر از فعاليت هاي فيزيولوژيك گياه به طور مستقيم يا غير مستقيم نقش دارند.