تجزيه و تحليل ترجيح كدوني ژن هاي رمز كننده آنتي پورتر Na+/H+ واكوئلي در گياهان مقاوم و حساس به شوري

به منظور بررسي و مقايسه ترجيح كدوني در ژن هاي رمز كننده آنتي پورتر Na+/H+ واكوئلي در گياهان مقاوم و حساس به شوري، 50 ژن از 32 گياه مقاوم به شوري مختلف و 50 ژن از 17 گياه حساس به شوري مختلف از پايگاه داده NCBI گرفته شد. با استفاده از سايت هاي GENE INFINITY و Mobyle portal تعداد، فراواني و ساير شاخص هاي مربوط به ترجيح كدوني اندازه گيري شدند. نتايج نشان داد كه به طور كلي در گياهان مقاوم به شوري ميانگين فراواني مربوط به كدون هايي بود كه به نوكلئوتيد تيمين ختم مي شدند(34/26 درصد) و كمترين ميانگين فراواني مربوط به كدون هايي بود كه به نوكلئوتيد آدنين ختم مي شدند(20/67 درصد) و در گياهان حساس به شوري نيز بيشترين وكمترين ميانگين فراواني به ترتيب مربوط به كدون هايي بود كه به نوكلئوتيد تيمين و آدنين ختم مي شدند( 31/32 درصد و 19/99 درصد) بررسي كدون هاي مترادف در اسيد آمينه هايي كه داراي بيش از 2 كدون بودند. در گياهان حساس و مقاوم به شوري نشان داد كه بين بعضي از كدون ها از لحاظ آماري در سطح 5 درصد و 1 درصد هم بستگي معني دار وجود دارد. وجود هم بستگي بين كدون هاي مترادف نشان دهنده ي اين است كمه ارتباطي بين مقدار فراواني اين كدون ها در توالي ژنومي وجود دارد. نتايج آزمون t جفت شده نشان داد كه تعداد و ميانگين فراواني كدون ها بين گياهان مقاوم و حساس به شوري تفاوت معني داري ندارد.شاخص خاي FOP و CBI بين دو گروه مقاوم و حساس در سطح 1 درصد متفاوت بود.