بررسي بيوانفورماتيكي ژن HRD در گياه آرابيدوپسيس تاليانا

به منظور بررسي بيوانفورماتيكي ژن HRD در گياه آرابيدوپسيس تاليانا، توالي نوكلئوتيدي ژن مذكور از بانك اطلاعاتي TAIR گرفته شد و با استفاده از سايت هاي بيوانفورماتيكي مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. آناليز ناحيه پيشبري اين ژن براي تعيين عناصر تنظيمي صورت گرفت و نتايج نشان دهنده وجود تعداد متنوعي عناصر تنظيمي چون MBS ، TC- rich reapet BOX4، ، GAG-motif و AE- box در اين ناحيه بود كه بيان كننده نقش اين ژن در مسيرهاي مختلف فيزيولوژيك مي باشد. همچنين بررسي ترجيح كدوني نشان داد كه اين ژن داراي 184 كدون (بجز كدون خاتمه) است كه كدون هاي با انتهاي u با 0/34 بيشترين تعداد و كدون هاي با انتهاي A با 0/189 داراي كمترين تعداد مي باشد. آناليز توالي پروتئيني نشان داد كه وزن مولكولي ونقطه ايزوالكتريك آن به ترتيب 46136/9 و 5/17 مي باشد. همچنين الگوي بيان اين ژن مورد بررسي قرار گرفت و مشخص شد. ميزان بيان اين ژن در مراحل مختلف نموداراي بيان كمي است و تنها در مرحله غلاف كامل مقداري بر بيان آن افزوده مي شود.