بررسي مناطق با آنتي ژنسيتي بالا در ژن آلفا توكسين باكتري كلستريديوم نويي تيپ A

باكتري كلستريديوم نويي سيتوتوكسيني با نام آلفا توكسين توليد مي كند كه با وزن مولكولي 250 كيلو دالتون داراي فعاليت آنزيمي است و بر روي گيرنده هاي Rho سلول هاي پستانداران تاثير مي گذارد. پيش بيني نواحي اتصال به MHC در يك آنتي ژن خاص در شناسايي بيماري ها و طراحي پپتيد واكسن موثر است. روش هاي آزمايشگاهي براي شناسايي نواحي آنتي ژنتيك سخت و زمان براست. استفاده از روش هاي محاسباتي براي پيش بيني مناطق آنتي ژنتيك اين زمان را كاهش مي دهد. در تحقيق حاضر نواحي باآنتي ژنسيتي بالا در آلفا توكسين به كمك ساختار دوم پروتئين نقشه هيدروفوبيسيته و الگو ريتم Kolaskar- tongaonkar بررسي گرديد. نتايج نشان داد كه بيشترين قطعات با آنتي ژنسيته بالا در نيمه دوم پروتئين (اسيد آمينه 1000+) است، بنابراين نيمه دوم مي تواند براي ساخت قطعات كوچك با بيشترين احتمال آنتي ژنسيتي استفاده شود.