بررسي سير تكاملي و همولوژي دومين هاي پروتئين پايرين

مقدمه: پروتئين پايرين از ژن MEFV كه در 16p13.3 قرار دارد، كدمي شود و داراي 781 اسيدآمينه است. دمين پايين از خانواده دومين هاي مرگ بوده و دربين پروتئين هاي پيش التهابي مشترك است . از اين رو بررسي دومين هاي اين پروتئين و ارتباطات فيلوژنتيكي آنها، فهم بهتر تعاملات پروتئين ها در مسير هاي التهابي و مكانيسم تكامل پروتئين را سبب مي شود. روش ها: تاكنون مطالعه اي بر روي ارتباطات تكاملي و همولوژي بين دومين هاي مختلف پايرين صورت نگرفته است، بنابراين دراين تحقيق با استفاده از توالي نوكلئوتيدي و پروتئيني گرفته شده از سايت NCBI و اطلاعات حفاظت شدگي دومين ها از سايت Pfam و استفاده از نرم افزار BioEdit درخت فيلوژنتيكي رسم شد. همچنين تركيب نوكلئوتيدي و آمينو اسيدي دومين ها از طريق نرم افزار MEGA5.5 بررسي شد. نتايج: دو مين هاي موردبررسي همولوژي داشته و دومين هاي NLRP4 و NLRP11 به يكديگر شبيه و به NLRP8 در مقايسه باNLRP13 شبيه ترند ودومين NLRP4 قدمت بيشتري دارد. در بررسي تفاوت نوكلئوتيدي اگزون 2و 10 اگزون هيستيدين كمترين و لوسين، گلوتاميك اسيد و سرين بيشترين ميزان آمينو اسيد در دومين ها هستند. گوانين بيشترين درصد و تيمين يا يوراسيل كمترين ميزان را دارا مي باشند.