مطالعه خصوصيات فيزيك و شيميايي و تعيين جايگاه فيلوژنتيكي دومن شاخص آنزيم نوكلئاز PARS II

نوكلئازهاي خانواده S1/P1 دسته اي از آنزيم هاي نوكلئاز مي باشند كه بافعاليت اختصاصي خود، مولكول هاي اسيدنوكلئيك تك رشته اي و همچنين نواحي تك رشت اي موضعي در مولكول هاي دو رشته اي را هدف قرار مي دهند. اين نوكلئازها به طور گسترده در مطالعات تعيين ساختمان مولكولي اسيدهاي نوكلئيك، نقشه يابي جهش ها و رديابي پلي مورفيسم هاي تك نوكلئوتيدي مورد استفاده قرار مي گيرند. تمام نوكلئازهاي اين خانواده، صرف نظر از توالي هاي سيگنال پپتيد در دو انتهاي آمين و كربوكسيل، داراي يك دومن شاخص موسوم به دومن S1/P1 مي باشند كه اين دومن در حقيقت، توالي بالغ پروتئين را تشكيل مي دهد. علاوه براين ، دومن شاخص در تمام نوكلئازهاي اين خانواده داراي مناطق و جايگاه هاي فعال ويژه اي مي باشدكه به صورت حفاظت شده باقي مانده اند. در تحقيق حاضر، خصوصيات فيزيك وشيميايي و جايگاه فيلوژنتيكي دومن شاخص توالي ژني نوكلئاز PARS II از خانواده S1/P1 كه به تازگي از گياه جعفري جداسازي گرديده است. در مقايسه با مهم ترين و شناخته شده ترين اندونوكلئازهاي اختصاصي تك رشته مورد بررسي قرار گرفت. بررسي هاي انجام شده نشان داد كه اين نوكلئاز با دارا بودن تمام ويژگي ها و مشخصه هاي خاص اندونوكلئاز هاي خانواده S1/P1، از ديدگاه فيلوژنتيكي به زير گروه اندونوكلئازهاي اختصاصي DNA هترودوپلكس تعلق دارد.