پيش بيني اپيتوپهاي افكتور پراكسيردوكسين در نماتد Globodera rostochiensis

نماتد طلايي يا نماد سيستي سيب زميني Globodera rostochiensis يكي از مهمترين عوامل خسارتزا در مزارع سيب زميني ميباشد. اين نماتد سبب ايجاد لكه هاي سفيدرنگي در سطح ريشه گياهان آلوده ميگردد. اين لكه ها حاوي ماده هاي نابالغي هستند كه از بشره هاي ريشه به بيرون آمده اند. هر ساله خسارت بالايي توسط اين نماتد به محصول سيب زميني وارد ميگردد. يكي از مولكولهاي اصلي ترشحي كه نقش مهمي در پروسه آلودگي موفق نماتد در گياه دارد پراكسيردوكسين مي باشد. اين تركيب توانايي تجزيه كردن پراكسيد هيدروژن كه يك تركيب دفاعي مهم در گياه ميباشد را داراست. بدين ترتيب سيستم دفاعي گياه در برابر نماتد از بين ميرود و نماتد براحتي گياه را كلونيزه كرده و آلودگي ايجاد ميگردد. به منظور كنترل اين نماتد روشهاي زيادي مطرح شده است ولي هيچ كدام كارايي بسيار خوبي نداشته اند . بنابراين روش هاي تئوري براي پيشگويي اپي توپها گسترش زيادي يافته است كه منجر به سنتز پپتيدهايي شده كه از نظر تست هاي تشخيصي ايمني و نيز توليد واكسن اهميت زيادي دارند. مطالعه حاضر براي كنترل و يا ممانعت از گسترش نماتد طلايي سيب زميني طراحي شده است كه با استفاده از ابزارهاي بيوانفورماتيك به پيشگويي اپيتوپ هاي پيوسته افكتور پراكسيردوكسين پرداخته كه جهت طراحي ملكولي در پروسه هاي توليد آنتي بادي كاربرد دارد. اميد است با استفاده از چنين تكنيكهايي سارت عوامل بيماريزاي گياهي را با ايمني بخشيدن به گياه تا حد مطلوبي كاهش دهيم.